上回我们介绍了环形热图(点击查看:环形热图绘制),有些小伙伴问到:分组数据可以做环形热图吗?为了解决这个问题,派森诺基因云平台推出了分组环形热图。特别适用于带有分组信息的基因表达量数据、相关性数据等。下面我们就来一起瞧瞧,如何绘制分组环形热图。
一、上传数据格式
第一列为基因分组名称,第二列为基因名,第三列开始为每个样本中各基因的表达量。
二、图形解读示例
以基因表达量结果绘制热图为例,由外到里展示为4圈:
第一圈:基因分组名称;
第二圈:基因名;
第三圈:每个样本中各基因的表达量,值的大小以颜色表示,如红色为较低表达,蓝色表示较高表达;
第四圈:聚类树,可通过选择合适的聚类方法和距离计算方法对基因在样本中表达量接近的基因进行聚类。
三、图表设置
3.1 调整圆环缺口间隙
通过调整圆环缺口,可以控制组与组之间的间隙。为呈现最优的绘图效果,缺口的度数要< 360°➗分组数。
3.2 调整圆环半径(宽度)
四、数据处理
可选择是否对数据进行标准化处理,还可以调整聚类方法和距离算法对行聚类或者不聚类。
五、其他设置
可以分别控制分组标签,行列标签的显示。
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