QSAR平台——自动化QSAR模型在药物设计中的应用

摘要：传统QSAR模型需要充分挖掘算法和描述符适用性，每种算法和不同的描述符都要单独建立一个模型，非常耗费时间。GSK公司搭建了一个QSAR平台用于构建和分析QSAR模型系统。该平台是通过Pipeline Pilot构建的，可以处理连续型和分类型数据，并构建易于使用的多种模型。该平台已得到了两个公开数据集的验证与演示。

MaXFlow生物医药智能创新平台，由创腾科技自主研发，旨为不同领域的一线创新科技工作者提供一个合作共享的B-S架构平台。以“数据自由，模型自由”为理念，在结构模型与预测模型进行融合的基础上，实现模拟与AI需求的合并，为研发赋能。

QSAR平台——自动化QSAR模型在药物设计中的应用

ref：J Comput Aided Mol Des. 2013 Apr;27(4):321-36；IF=2.356

链接： 10.1007/s10822-013-9648-4.

传统QSAR模型需要充分挖掘算法和描述符适用性，每种算法和不同的描述符都要单独建立一个模型，非常耗费时间。GSK公司搭建了一个QSAR平台用于构建和分析QSAR模型系统。该平台是通过Pipeline Pilot构建的，可以处理连续型和分类型数据，并构建易于使用的多种模型。QSAR平台提供了一个框架，构建了不同建模算法、不同描述符组合和不同数据分割（训练集和测试集划分）组合成的多种多样的QSAR模型，并提供了验证、分析和比较模型的方法，使用户能够选择最合适的模型。该平台可自动化实现数据准备、结构标准化、描述符计算、QSAR模型构建与验证等步骤，并为有经验的用户提供底层参数的完全访问权限，满足不同用户，不同领域的应用。Pipeline Pilot构建的QSAR平台还允许将选定的模型以web形式进行发布，使得其他用户便于访问和使用。该平台已得到了两个公开数据集的验证与演示。

 

图一 QSAR平台支持的算法模型

 

图二 QSAR平台结果演示