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R语言之生信④TCGA生存分析1
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正文
生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断,研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法,也称生存率分析或存活率分析。简单来说生存分析是研究生存时间的分布规律,以及生存时间和相关因素之间关系的一种统计分析方法
生存分析应用场合
某些临床特征对病人的影响有哪些
病人个体三年存活率有多少
两组病人之间的生存率有什么差异
生存分析使用的方法:
Kaplan-Meier plots to visualize survival curves(根据生存时间分布,估计生存率以及中位生存时间,以生存曲线方式展示,从而分析生存特征,一般用Kaplan-Meier法,还有寿命法)
Log-rank test to compare the survival curves of two or more groups(通过比较两组或者多组之间的的生存曲线,一般是生存率及其标准误,从而研究之间的差异,一般用log rank检验)
Cox proportional h