linux分析mirna,全世界的miRNA分析工具都在这里 | 平行对比多个工具的靶基因预测结果...

如果评选年度最佳生物信息网站，我就选tools4miRs！

来自伟大的波兰，居里夫人的祖国！纪念居里夫人诞辰150周年。

延伸阅读：居里夫人诞辰150周年 | 重温饶毅《光荣背后的辛酸》——科研春秋，《知识分子》旗下的科学史平台。

这是去年发表在Bioinformatics上的一个工具，Tools4miRs，https://tools4mirs.org/，目前已收录了200个miRNA分析工具。有高通量测序数据的分析工具，也有单个序列的分析工具。

包括数据库、测序数据分析、All-In-One工具、7类software，还提供多个工具平行预测靶基因功能。

其中，7类software包括：鉴定已知miRNA

鉴定isomiRs

分析新的miRNA/Precursor

差异表达分析

靶基因预测

靶基因功能分析

miRNA的SNP分析

以靶基因预测为例，有以下工具。列出了在线还是本地、适用的物种、算法特点、是否要求高通量测序数据作为输入、带不带靶基因功能富集分析功能、参考文献。

References列有该工具Homepage链接、paper网页链接、Pubmed引用链接。真是人性化啊！如果能按参考文献的年代排序就做到了极致。

工具太多，眼花缭乱？还提供筛选功能，太贴心了。

还能直接选择多个个工具，在它的服务器上预测靶基因，平行对比多个工具的结果。

实践出真知，https://tools4mirs.org/，收藏本帖，在电脑端打开微信，开始实践吧！