形态创新在进化过程中产生很大的影响，并在不断变化的环境中提供稳定的力量；例如，允许植物沿着直立树木攀爬的创新结构的产生，为许多植物群的生存做出了贡献。在被子植物的进化史上，攀爬习性在不同家族中得到多次发展。此外，攀爬创新使植物群与相关世系相比更加多样化。面对空间竞争和邻近植物阴影带来的不利影响，攀爬植物已经发展出多种策略来支撑其直立朝向林冠层，以增加对阳光的利用。一种主要的策略是抱茎卷须的发育，约有17种形态变异，分为变型叶或枝条两大类型。
在产生卷须的被子植物家族中，葫芦科是葫芦目中蔷薇属的第二大家族，是两个最大的双子叶植物分支之一。葫芦科由Linnaeus(1792)根据花卉特征建立，而卷须是一种同形特征，被认为与芽同源。葫芦科成员大多是一年生草本植物的藤本植物或多年生藤本植物，并包括许多重要的蔬菜和水果，例如黄瓜，甜瓜，冬瓜，西瓜，南瓜和苦瓜。葫芦还有一些其他特征对人类有利。此外，葫芦科还用作模型来了解卷须发育和苦味化合物生物合成以及古多倍化的分子调控。
葫芦卷须无分支或简单分支，它们卷曲不低于分支点，这是葫芦生物分类的特征。该家族的另一个显着特征是具有坚硬外壳的肉质水果，如黄瓜，西瓜和南瓜。同时，葫芦丝中还发现了其他水果类型，包括浆果、蒴果和翅果。葫芦科包括将近1000种，主要原产于热带和亚热带地区，但在温带地区也发现了少数物种。传统的系统学方法使用卷须特征和果实类型以及种皮和花粉结构将葫芦科分为两个亚科130个属。用五个叶绿体标记物重建了葫芦科的早期分子系统发育，支持了葫芦亚科和楠木亚科两个亚科。最近的葫芦科系统发育分析使用来自核，质体和线粒体基因组的14种分子标记，产生了包含95-97属的新分类。但是，由于分子标记的系统发生信号有限而丢失数据的比例很大，部分关系仍未解决。需要一个全面的葫芦科系统发育关系，以了解该家族的进化历史和比较研究。
与质体标记相比，核基因提供了父母双方的遗传信息。此外，随着新的测序技术的出现，使用来自转录组和基因组的大量核标记的系统发育解决了一些长期的模棱两可的问题。此外，已经发布了来自8个属的12个葫芦科基因组，为比较分析提供了重要资源。
今天带来的文章是2020年5月20日复旦大学生命科学学院黄建勋副研究员团队联合美国宾夕法尼亚州立大学马红教授在Molecular Plant 杂志上报导了题为“Phylotranscriptomics in Cucurbitaceae Reveal Multiple Whole Genome Duplications and Key Morphological and Molecular Innovations”的研究论文。他们使用127个新测序的转录组和多组核基因组，与先前的数据集结合，重建了葫芦科系统发育，并在众多属之间建立了系统发育关系。系统发育模型包含八个明确定义的主要进化枝，每个进化枝具有一个或多个族。此外，他们的系统转录组分析确定了多个WGD，并得到了多个测序基因组同轴区的支持。统计分析支持了物种多样化率的四个增长。祖先的15个形态特征重建揭示了卷须，花和果实有关的特征转变的趋势，以及一些平行进化的情况。此外，还证明在白垩纪-古近纪(K-Pg)的时期，形态变化和多样化速率的变化同时发生。他们的研究表明，WGD对增加生物多样性具有驱动作用&#
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