里测量面积的快捷键_Image J角度测量、粒径测量和其他基础测量

01

角度测量

角度测量有专门的角度测量工具Angel Tool，不过利用直线工具也可以进行简单的角度测量。

1、选择File-Open Samples-Leaf，打开软件自带例图；

2、利用Angel Tool(角度工具)画出要测量的角度，比如下图的叶脉夹角，然后选择Analyze-Measure(快捷键Ctrl+M或者M)，即可得到角度值；

3、利用Straight Line(直线工具)画一条直线(下面的青色线条)，然后选择Analyze-Measure(快捷键Ctrl+M或者M)，也可以获得一个角度，这个角度是直线与X轴正半轴的夹角；

02

粒径测量

Feret’s diameter(费雷特直径)是对不规则颗粒大小描述的常用参数。经过该颗粒的中心任意方向的直径称为一个费雷特直径。可以每隔10°方向取一个费雷特直径，一般用这36个费雷特直径一起描述一个颗粒，36个费雷特直径可以取平均费雷特直径、最大费雷特直径和最小费雷特直径；如果为了获得更精确的数据，旋转角度步长可以更小。

在Image J里面，Feret表示最大费雷特直径，采用a double loop over the corner pixels算法进行计算；minFeret表示最小费雷特直径，采用0.5度步长旋转角度进行计算。

下面统计一些颗粒的粒径，前面4步具体见：Image J进行细胞和菌落计数：不能装逼的几个方法。

1、File-Open Samples-Blobs，打开一张例图；

2、Image-Type- 8-bit；

3、Image-Adjust-Threshold，默认参数，Apply；

4、Process-Binary-Watershed；

5、Analyze-SetMeasurement，勾选Feret’s diameter；

6、Analyze-Analyze Particles，勾选如下;

7、Results(结果)里面可以看到粒径信息：Feret(最大费雷特直径)、FeretX、FeretY是最大费雷特直径的左上角端点坐标，FeretAngle表示最大费雷特直径和X正半轴夹角，minFeret表示最小费雷特直径；可以自行计算最大和最小费雷特直径的几何平均值来表示粒径大小。

03

其他基础测量

其他基础测量是指ImageJ 的Set Measurements中所列的测量选项。在进行测量(Analyze-Measure)之前需要先勾选所需要测量的选项，最后结果才会有该项目。

选择Analyze-SetMeasurement：

在《高分文献中的Western Blot定量柱状图是如何实现的?》一文中我们已经用过Area(面积)和IntergratedDensity(加和密度)测量了。剩下的都是一些基于选区的常规测量，把这些测量选项翻译如下，都比较好理解，顾名思义即可。

下面几个可能不太好理解，大概说一下。

• LimitTo Threshold(限定到阈值)是指通过Threshold建立选区之后，进行的测量是否限定在选取之内，如果不勾选，测量的就是整个图片；
• Display Label(显示图源标签)在涉及到多张图片测量的时候很有用，可以将每一个测量结果进行来源区分；
• Add To Overlay(添加到Overlay)，如果在选取测量之后，还需要进一步操作的时候可以勾选此项。
• Redirect To(重定向)可以将同样的选区测量设置，应用到相同视野的下一张照片，无需再次建立选区。