单基因gsea_文献学习生信—单基因SYT16分析

最新推荐文章于 2024-05-31 09:30:00 发布

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文章标签：单基因gsea

本文通过TCGA数据和多种生物信息学方法，揭示了SYT16基因在低级别胶质瘤（LGG）中的重要作用。研究发现，SYT16高表达与肿瘤恶化和较差的生存预后相关，并与免疫细胞浸润程度负相关。GSEA分析揭示了SYT16涉及的关键信号通路，表明其可能作为免疫治疗的新靶点。

摘要由CSDN通过智能技术生成

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SYT16是LGG预后标志物与免疫浸润相关

背景：

胶质瘤是致命脑肿瘤。低级别脑肿瘤是胶质瘤中最常见的类型。在低级别胶质瘤中，免疫浸润微环境与总生存期相关。SYT16基因在肿瘤中的作用尚未见到明确报道。我们评估了TCGA中SYT16在LGG中的作用。

方法：

应用GEPIA数据库分析SYT16基因表达情况以及与生存的关系。应用logistics回归分析临床因素与SYT16的表达情况。单因素和多因素COX分析比较临床因素与生存的关系。探究了SYT16与肿瘤免疫的关系。应用GSEA分析SYT16涉及功能。此外应用TIMER数据库探究了SYT16表达与免疫浸润程度的关系。

结果：

单因素logistic回顾分析显示升高的SYT16与肿瘤分级相关。多因素分析显示上调的SYT16表达是独立的预后因子。SYT16表达水平与免疫浸润(B细胞，CD4+ T细胞，巨噬细胞，中性粒细胞，DC细胞)负相关。GSEA分析、GO和KEGG分析确定了重要信号通路。

结论:SYT16是预后标志物与免疫浸润相关。