unet详解_Unet 论文解读 代码解读

论文解读

network

Architecture:

a. U-net建立在FCN的网络架构上，作者修改并扩大了这个网络框架，使其能够使用很少的训练图像就得到很 精确的分割结果。

b.添加上采样阶段，并且添加了很多的特征通道，允许更多的原图像纹理的信息在高分辨率的layers中进行传播。

c. U-net没有FC层，且全程使用valid来进行卷积，这样的话可以保证分割的结果都是基于没有缺失的上下文特征得到的，因此输入输出的图像尺寸不太一样(但是在keras上代码做的都是same convolution)，对于图像很大的输入，可以使用overlap-strategy来进行无缝的图像输出。

tile strategy

d.为了预测输入图像的边缘部分，通过镜像输入图像来外推丢失的上下文(不懂)，实则输入大图像也是可以的，但是这个策略基于GPU内存不够的情况下所提出的。

e.细胞分割的另外一个难点在于将相同类别且互相接触的细胞分开，因此作者提出了weighted loss，也就是赋予相互接触的两个细胞之间的background标签更高的权重。

weighted loss

代码解读

layers

初始化weights 和 bias

def weight_variable(shape, stddev=0.1, name="weight"):

initial = tf.truncated_normal(shape, stddev=stddev)

return tf.Variable(initial, name=name)

def weight_variable_devonc(shape, stddev=0.1, name="weight_devonc"):

return tf.Variable(tf.truncated_normal(shape, stddev=stddev), name=name)

def bias_variable(shape, name="bias"):

initial = tf.constant(0.1, shape=shape)

return tf.Variable(initial, name=name)

创建卷积层和池化层

这里的padding使用的是VALID，和论文里面所指出的是一样的。deconv2d是反卷积，也就是upsampling，以第一个upsample为例，输如的x的shape为[None,28,28,1024]，则输出的shape为[None,52,52,512]。反卷积的计算细节参考https://blog.csdn.net/nijiayan123/article/details/79416764。

def conv2d(x, W, b, keep_prob_):

with tf.name_scope("conv2d"):

conv_2d = tf.nn.conv2d(x, W, strides=[1, 1, 1, 1], padding='VALID')

conv_2d_b = tf.nn.bias_add(conv_2d, b)

return tf.nn.dropout(conv_2d_b, keep_prob_)

def deconv