kettle case值分组标志_KM生存曲线经logRNA检验后也可以计算HR值

本文探讨了如何在Kettle中利用基因表达量进行病例分组,并通过KM生存分析和logRank检验评估生存差异。作者发现可以计算hazard ratio(HR)以确定风险因子,同时分享了R语言计算HR的代码示例,强调了低表达量的保护因子和高表达量的风险因子概念。此外,还概述了生存分析的基本定义,包括生存时间、生存概率和中位生存期等。
摘要由CSDN通过智能技术生成

最近根据基因表达量对病人进行分组后,使用KM生存分析的logRNAK法来检查两个组的病人的生存差异,得到了如下的图:

99150ad65aefc7a8ce4d1c0eb574f5ac.png

可以很明显看到,根据基因表达量把病人分成高表达组合与低表达组,经过log rank 检验,可以看到两组病人的生存是有统计学显著差异的,而且我们可以看到,基因表达量越高,病人死亡风险越高,所以我们可以把这个基因在表达水平上看做是风险因子,而我们通常判断风险因子或者保护因子是根据hazard ratio来的,可以看官方教材:https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/hazard-ratio

As for the other measures of association, a hazard ratio of 1 means lack of association, a hazard ratio greater than 1 suggests an increased risk, and a hazard ratio below 1 suggests a smaller risk.

所以我就突发奇想,是不是log rank 检验后也可以返回hazard ratio呢?

下面是KM生存分析和log rank检验的具体定义:

KM法即乘积极限法(pr
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值