R可视化：科研绘图之生存KM曲线图

最新推荐文章于 2024-06-29 14:45:19 发布
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分类专栏： R语言可视化 文章标签： r语言 数据分析
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介绍

ggsurvfit 是一个基于 R 语言的包，它扩展了 survival 包的功能，允许用户使用 ggplot2 的语法来创建美观的生存曲线图。KM曲线，即Kaplan-Meier曲线，是一种非参数统计方法，用于估计生存函数，即在给定时间点生存下来的概率。

ggsurvfit包

  1. 美观性：ggplot2 提供了一种强大的图形语法，可以创建高度定制化和美观的图形。
  2. 易用性：ggsurvfit 允许用户利用熟悉的 ggplot2 语法来绘制生存曲线，使得图形的创建过程更加直观和简单。
  3. 扩展性：ggsurvfit 可以与 ggplot2 的其他扩展包一起使用，例如 ggpubr
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可视化绘图技巧100篇分析篇（二）-生存曲线（LM曲线）
getusushu的博客
05-08 513
存活曲线，最初由美国生物学家雷蒙·普尔在1928年提出，是为生态学依照物种的个体从幼体到老年所能存活的比率，所做出的统计曲线。存活曲线一般以存活数量的对数值为纵坐标，以年龄为横坐标作图，从而把每一个种群的死亡-存活情况绘成一条曲线。存活曲线可归纳为3种基本类型：A型表示大部分个体都能活到生理寿命，如人类和一些大型哺乳动物；B型，表示各年龄期存活率基本相似，如水螅；C型，表示幼体死亡率高，如大多数鱼类。
R语言数据可视化-KM生存曲线
笑不语的博客
05-29 3338
生存分析（Survival Analysis）是用来描述和分析时间因素对个体生存的影响，其中生存曲线一般是常见的图表之一。而通过Kaplan-Meier（KM）法，可以绘制生存曲线用以描述研究对象的存活情况。KM生存曲线是用来描述随时间推移一个群体中存活的比例，通常是用来描述疾病的存活率。在 KM 生存曲线上，X 轴表示时间，而 Y 轴表示生存率（或存活概率或累计存活率），即一个人在某一时间存活下来的概率。KM 生存曲线通常呈现出一条向下的曲线，这个曲线被称为“生存函数”。生存函数始终在 1.0 以上开始。
R可视化：R语言基础图形合集
H20230717的博客
06-12 1102
R语言ggplot系列基础科研绘图合集
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本期R包：survival和survminer，survival建立生存函数，survminer内置ggplot2，ggpubrg等包，美化曲线。一行代码配一个图，逐步讲解代码含义。喜欢的...
R语言绘制圈图、环形热图可视化基因组实战：展示基因数据比较
拓端研究室TRL
09-27 324
原文链接：http://tecdat.cn/?p=23891可以使用环状图形展示基因数据比较。可以添加多种图展信息，如热图、散点图等。本文目标:可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮。可以通过R来实现环形热图。首先，让我们生成一个随机矩阵，并将其随机分成五组。mat1=rbind(cbind(matrix(rnorm(50*5,mean=1),nr=50), ...
R语言生存分析可视化分析
拓端研究室TRL
11-29 1895
指的是一系列用来探究所感兴趣的事件的发生的时间的统计方法。被用于各种领域，例如：癌症研究为患者生存时间分析，“事件历史分析”的社会学在工程的“故障时间分析”。在癌症研究中，典型的研究问题如下：某些临床特征对患者的生存有何影响？个人三年存活的概率是多少？各组患者的生存率有差异吗？R语言生存分析Survival analysis原理与晚期肺癌患者分析案例最近我们被客户要求撰写关于的研究报告，包括一些图形和统计输出。在这里，我们从定义生存分析的基本术语开始，包括：生存时间和事件。
可视化绘图技巧100篇分析篇（二）-生存曲线（LM曲线）（补充篇）
getusushu的博客
05-09 1191
K-M曲线——研究某因素与生存结局（阳性事件）及时间是否相关相比于之前使用的寿命表法（Life-table method），这种方法更加充分地利用了信息，给出更准确的统计量。因此，K-M曲线也成为了生存分析中最常用的方法之一。当我们需要描述生存分析数据时，我们常常使用生存曲线来展示，这个时候需要估计每个时间点位的生存率，用的就是K-M方法。如果随访时间足够长、生存结局理论上均为1（发生阳性事件），但实际研究中，不一定所有研究对象在随访过程中均出现了阳性事件，此类患者的生存结局是0。
R语言survminer包的ggsurvplot_df函数基于生存汇总data.frame信息绘制生存曲线、可视化不同估计方式获得的生存曲线信息（KM法、韦伯分布法）
statistics+insight+vista+power
01-04 326
R语言survminer包的ggsurvplot_df函数基于生存汇总data.frame信息绘制生存曲线（使用汇总dataframe信息可视化生存曲线）、可视化不同估计方式获得的生存曲线信息（KM法、韦伯分布法）
R|生存分析 - KM曲线 ，值得拥有姓名和颜值
weixin_39556044的博客
03-12 9903
文章目录一 数据和R包二 原生KM曲线三 优化KM曲线1 survminer绘制KM曲线2 坐标轴，标题，主题优化3 Risk Table4 添加注释信息 本文首发于“生信补给站”：https://mp.weixin.qq.com/s/lpkWwrLNtkLH8QA75X5STw 生存分析作为分析疾病/癌症预后的出镜频率超高的分析手段，而其结果展示的KM曲线也必须拥有姓名和颜值！ 生存分析相关...
Python 数据分析：基于Plotly 的动态可视化绘图,557页
09-07
plotly使用入门
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09-20
梳理总结了R语言8种数据可视化案例，涵盖了基本及高级绘图工具及函数，方便后来者学习。
【源码】数据可视化：基于Echarts + GeoJson实现的地图视觉映射散点（气泡）组件【7】 - 海南省.zip
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1、Echarts ，Python 实现的地图 视觉映射图，散点（气泡）图。 2、包括地图坐标经纬度geoJSON数据。 3、详细手册参考我的博文： https://blog.csdn.net/lildkdkdkjf/article/details/120130595 4、技术支持QQ微信...
微生物共现网络可视化：按模块进行圆形布局
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1. 对微生物共现网络的模块进行划分； 2. 按照模块大小排序，对前面的模块进行着色，其余归为其它； 3. 对各模块进行圆形布局，求解布局坐标 4. 利用ggraph对网络布局、节点可边进行可视化
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2401_85812026的博客
06-27 598
通过本文的指导，您应该已经能够在Conda环境中成功安装并配置R语言环境了。无论是进行数据分析、统计建模还是图形表示，R语言都是一个强大的工具。Conda提供了一个灵活的环境管理方式，使得在Linux系统上使用R语言变得更加简单和高效。记住，数据科学是一个不断学习和探索的过程。掌握在Conda中安装和管理R语言环境，将为您的数据科学之旅增添一双翅膀。现在，开启您的R语言编程之旅，探索数据的无限可能吧！🚀注意：本文中的命令和代码示例假定您使用的是Linux操作系统。
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weixin_47634487的博客
06-24 416
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RDMA建链的3次握手和断链的4次挥手流程？
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06-25 1051
双端都需要发送所以累计四次。更多细节以后逐渐补充。
如何迁移R包
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06-26 481
迁移R包涉及将一个或多个R包从一个系统转移到另一个系统。
python数据分析:基于plotly 的动态可视化绘图.pdf 下载
01-19
《python数据分析:基于plotly的动态可视化绘图.pdf》是一本关于使用Python进行数据分析的书籍，主要介绍了如何利用plotly库进行动态可视化绘图。 数据分析是通过收集、清洗、加工、分析和呈现大量数据来揭示其中潜在规律和洞察的过程。而可视化则是将数据以图表等可视化方式展示，帮助我们更直观地理解和解读数据。plotly是Python中一款功能强大的可视化库，它可以生成各种交互式图表，支持动态可视化和在线展示。 《python数据分析:基于plotly的动态可视化绘图.pdf》通过实例演示了如何使用plotly库进行数据分析中常用的可视化操作，包括折线图、柱状图、散点图、饼图、地理图等。使用plotly库可以轻松创建动态可视化图表，通过调整参数和设置动画效果，可以让图表更生动、更具吸引力。 动态可视化是一种通过动态变化的图表来展示数据的方法。它可以帮助我们更好地理解数据的变化趋势和规律，发现数据中隐藏的特征和模式。在数据分析中，动态可视化常用于时间序列数据、实时数据等领域，能够直观地展示数据的变化过程和动态趋势。 综上所述，《python数据分析:基于plotly的动态可视化绘图.pdf》是一本介绍如何使用plotly库进行动态可视化绘图的书籍，通过实例演示了使用plotly库创建各种动态可视化图表的方法和技巧，对于对数据分析和可视化有兴趣的人来说，是一本不可多得的学习资料。

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