
最近还是做实验比较多,主要是DNA测序,转录组测序,还有做一写验证实验,所以就把学到的一些自己觉得重要的软件使用具体步骤记录下来,如果大家觉得有用的话就可以看看
生信方面主要就是在call SNP,具体步骤和方法还在试错中(各种采坑),在各种平台上跟着各位大佬的步骤写代码,等把整个流程跑通后也写一个详细操作流程,让大家也可以避免一些坑,或者现在有做过这个流程的可以交流交流呀(T_T")
用SnapGene软件进行DNA序列比对
1、打开snapgene软件 -> 点击“新DNA”

2、将需要比对的DNA序列或者参考基因序列复制到框内 -> 选择线性还是环状 -> 编辑文件名称(方便保存以后直接打开查看)-> 点击“可以”

3、继续点击左边窗口的“显示比对”出现比对窗口 -> 点击下面的“序列”查看序列比对信息 -> 点击“比对的序列”或者鼠标右键选择输入或者复制需要比对的序列

4、输入比对序列,选择测序数据还可以点击如图三角符号查看数据碱基峰值情况(前提是输入的序列文件是测序结果的)
此次比较的是参考DNA和包含克隆SNP位点的序列,可以观察到SNP杂合位点的双峰情况,最后验证生信分析结果的准确性

