今天要和大家分享的是2020年3月发表在Dose Response(IF=2.438)杂志上的文章“Identification of Key Genes and Pathways for Enchondromas by Bioinformatics Analysis”,作者利用GEO数据库中的原始数据,鉴定了内生软骨瘤(enchondromas,EC)中的差异表达基因(DEGs),然后通过GO分析和KEGG富集分析寻找到相关生物学特征,最后通过PPI网络构建确定了核心调控基因和模块,为进一步探索EC的诊断、预后和药物靶点提供理论依据。
一、研究背景
软骨瘤起源于透明软骨,出现在髓腔内时称为内生软骨瘤(enchondromas,EC)。内生软骨瘤在男性中更为常见,其发病高峰在20至30岁。这种癌症可以发生在活动脊柱的任何区域。EC的确切病因未知。因此,了解与EC病理过程相关的分子机制对于制定更有效的诊断和治疗策略至关重要。高通量基因表达分析平台特别是GEO数据库在医学肿瘤学中应用越来越广,作者利用GEO数据库中的原始数据进行生物信息学分析,发现了mRNA在EC发生、发展中的表达变化。