再点击GSE27411,进入以下界面。
然后点击Analyze with GEO2R。
点击Define groups,这里我们假设分为两组,分别是infected和uninfected。首先我们先输入infected,然后回车。接着再输入uninfected, 回车。完成后显示如下。
接下去我们可以看到下方有一个表格,其中前4行是unifected,接下去6行是infected。这里先点击第一行,条带会显示黄色,然后再点击Define groups里的uninfected,完成后原本黄色的条带会显示为粉红色,如下图。
依次类推。。。
分类完成后,鼠标往下滑,点击Top 250,最后界面显示如下。
操作到现在,其实寻找差异基因的步骤已经基本结束了,但是大家或许对这个表格的解读还是存在疑惑,接下去,大家跟着小编一起来解读一下这个表格的具体内容。
这里,所有基因的排序是根据P.Val值从小到大依次排列的,P值越小,越有理由相信该基因在组与组之间存在差异表达,而adj.P.Val是经过校正后的P值,其意义与P值一样,但更加