dparsf是什么_静息态数据处理(自己整理)--doumaly

本文详细介绍了静息态数据处理流程,包括数据预处理的各个步骤:格式转换、去除不稳定数据、时间层校正、头动校正、空间标准化、平滑、去线性漂移和滤波。特别讨论了DPARSF软件中Slice Timing的设置和头动校正参数的选择,以及空间标准化的两种方法:使用EPI模板和一致分割的T1像进行空间标准化。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Part1 数据的预处理

1、格式转换

2、去除前n个时间点的数据

3、时间层校正(Slice Timing)

4、头动校正(Realign)

5、空间标准化(Normalize)

6、平滑(Smooth)

7、去线性漂移(Detrend)

8、滤波(Filer)

一、DICOM格式——NIFTI格式。若数据遗失NIFTI格式则不用转,直接在工作目录下建

立一个子文件夹“FunImg”,将数据拷入其中即可

二、一般去10(8——20之间即可),由于机器刚启动等原因前面一些数据不稳定

三、Slice Timing的设置:以总层数25层为例

SPM中:Slice order:

Reference Slice 参考层一般取中间层,即第25层。因为扫描顺序为:

1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1

DPARSF中:1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1

四、头动校正后会在工作目录下生成Realign Parameter文件夹,其中有spm….ps这个文件,

用专业版的Aoboe Reader 打开可查看每个被试头动情况。或在Excludesubjects.txt文件下可查看头动数据(卡不同值时被排除被试情况)。对于患有疾病的患者:一般卡3mm 和3degre;而对正常人一般卡1.5mm和1.5degere或取2.

五、空间标准化即把被试的原始空间往标准空间上估计,以克服不同被试的脑结构之间的差

异问题。把结构像分割得到的信息来做功能像的空间标准化,有两种方式:

a、使用EPI模板进行空

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