Part1 数据的预处理
1、格式转换
2、去除前n个时间点的数据
3、时间层校正(Slice Timing)
4、头动校正(Realign)
5、空间标准化(Normalize)
6、平滑(Smooth)
7、去线性漂移(Detrend)
8、滤波(Filer)
一、DICOM格式——NIFTI格式。若数据遗失NIFTI格式则不用转,直接在工作目录下建
立一个子文件夹“FunImg”,将数据拷入其中即可
二、一般去10(8——20之间即可),由于机器刚启动等原因前面一些数据不稳定
三、Slice Timing的设置:以总层数25层为例
SPM中:Slice order:
Reference Slice 参考层一般取中间层,即第25层。因为扫描顺序为:
1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1
DPARSF中:1,3,5,7,9….,n,2,4,6,8,…n-1
四、头动校正后会在工作目录下生成Realign Parameter文件夹,其中有spm….ps这个文件,
用专业版的Aoboe Reader 打开可查看每个被试头动情况。或在Excludesubjects.txt文件下可查看头动数据(卡不同值时被排除被试情况)。对于患有疾病的患者:一般卡3mm 和3degre;而对正常人一般卡1.5mm和1.5degere或取2.
五、空间标准化即把被试的原始空间往标准空间上估计,以克服不同被试的脑结构之间的差
异问题。把结构像分割得到的信息来做功能像的空间标准化,有两种方式:
a、使用EPI模板进行空