conda 切换环境_【Python】conda和jupyter notebook使用

conda简介

Conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。Conda 是为 Python 程序创建的，适用于 Linux，MacOS 和Windows，也可以打包和分发其他软件。

conda分类：

• anaconda是包含一些常用包的版本(常用不代表自己的常用)

• miniconda则是精简版，需要啥装啥，所以推荐使用miniconda。 

miniconda下载地址：

• miniconda官网：https://conda.io/miniconda.html

anaconda下载地址：

• anaconda官网:  https://www.anaconda.com

Mac下miniconda安装和使用

下载：https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html

这里选择如下：

然后点击安装，根据提示进行安装即可

安装完成后；

终端输入：

conda list

添加频道：

官方channel：

conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge

官方的话这两个channel一般情况下足够使用。

说明：其实现在用国内的镜像比较多，官方的频道相较而言速度较慢。但也不是绝对的，有小伙伴跟我说他使用官方的频道也很流畅，所以见仁见智啦。另外，不建议加入大量的相同的频道，如添加了官方的bioconda之后又添加清华的bioconda镜像，没有必要，而且会拖慢速度。

清华镜像：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

显示安装的频道

conda config --set show_channel_urls yes

查看已经添加的channels

conda config --get channels

已添加的channel查看：

vim ~/.condarc

Windows下miniconda安装和使用

下载windows平台的安装包，点击安装后，进行环境变量配置：

打开控制台输入：

conda list

添加频道：

官方channel：

conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge

官方的话这两个channel一般情况下足够使用。

说明：其实现在用国内的镜像比较多，官方的频道相较而言速度较慢。但也不是绝对的，有小伙伴跟我说他使用官方的频道也很流畅，所以见仁见智啦。另外，不建议加入大量的相同的频道，如添加了官方的bioconda之后又添加清华的bioconda镜像，没有必要，而且会拖慢速度。

清华镜像：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

显示安装的频道

conda config --set show_channel_urls yes

查看已经添加的channels

conda config --get channels

conda使用

安装命令：

conda install xxx

搜索安装包：

conda search xxx

查看软件安装位置：

which xxx

安装特定版本：

conda install 软件名=版本号
conda install xxx=3.7

查看已安装的软件：

conda list

更新指定的软件：

conda update xxx

卸载指定的软件：

conda remove xxx

退出conda环境：

. ./deactivate
# 或者用 
conda deactivate

查看当前存在的环境：

conda env list

删除环境：

conda remove -n myenv --all

Pycharm开发软件中使用conda环境

进入设置

切换环境后就可以使用conda环境开发了。

jupyter notebook

Jupyter Notebook是Ipython的升级版，而Ipython可以说是一个加强版的交互式 Shell，也就是说，它比在terminal里运行python会更方便，界面更友好，功能也更强大。

安装指南网址：https://jupyter.org/install.html

启动命令:jupyter notebook

使用

1、新建：

2.点击Python3 出现框叫做单元格，你可以把你的代码分成一段段的单元格输入，然后可以逐个单元格地运行。

注意，这个功能是非常友好的，有时候只修改了中间的一小段代码，又不想全部代码都要重新运行的时候这个功能就非常有用了。

另外，单元格是可以改变顺序的。而且可以输出图片和绘图！ 

3.重命名，下载文档 可以点击Untitled也可以点击File-rename，下载的话点击File-Download as，其中下载格式很多，可以行尝试。

4.保存 Ctrl + S，默认是保存为ipynb，保存在你的主目录下！ 

5.删除某个cell 将光标停留在待删除的cell内，按下ESC进入命令模式，然后按两次d键即可删除该cell 

6.显示行号 点击View-Toggle Line Numbers 

7.撤销删除 点击esc后按z键 

8.删除选中的行(也可以是一行) 光标停在某一行(或者选中多行)，然后ctrl + D

完

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