分子动力学模拟软件_QuantumATK：更强大、更灵活的材料动力学模拟

概述

动力学模拟是一种重要的原子级模拟方法，通过求解原子运动的经典力学牛顿方程对相空间进行采样，不仅可以研究体系在相空间的演化过程，还可以通过产生的系列结构（系综）通过统计方法得到体系在非零温度下的各种性质。 动力学过程中的原子间相互作用力则可以通过多种方法求得，可以是密度泛函理论，也可以是经验力场。

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使用QuantumATK进行材料动力学模拟

• 可以用多种能量-力计算方法
  • 密度泛函理论（DFT-LCAO 和 DFT-PlaneWave）
  • 半经验量子力学模型（SemiEmpirical）
  • 经验力场（Forcefield）

• 支持多种系综和理论方法
  • NVE velocity verlet
  • NPT with stress mask
  • NPT/NVT（Berendsen）
  • NPT Melchionna
  • NPT with stress mask
  • Langevin

• 支持多种动力学方法
  • 平衡态分子动力学
  • 非平衡态分子动力学（RNEMD）计算热导
  • time-stamped force-bias Monte Carlo长时域的动力学方法
  • Metadyamics（PLUMED）：更快的对能量（自由能）面进行采样，获得大范围的结构-能量信息
  • 自适应动力学蒙特卡罗方法（adaptive kinetic Monte Carlo）：研究结构变化与机理

• 可控制局域温度、设定升温速率
• 计算过程中分析

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QuantumATK：高效的动力学引擎

基于QuantumATK高效的DFT、SE和ForceField计算引擎和MD代码的优化，分子动力学计算速度有明显优势。其中DFT、SE、ForceField均支持MPI大规模并行，并获得极大的速度提升。

基于DFT的MD计算速度测试结果7056原子的分子动力学（水分子）：在64MPI并行时，第一步MD耗时4分钟。

3220原子的分子动力学（固