admixture软件_Admixture使用说明文档cookbook

软件介绍

基因组选择中， 有时候测量了很多家系，如果想看一下这些家系的分类情况，可以使用软件对其进行分群。一般使用的软件就是STRUCTURE，但是STREUTURE运行速度极慢，admixture凭借其运算速度，成为了主流的分析软件。下面介绍一下admixture的使用方法。

官方网址

Admixture

http://software.genetics.ucla.edu/admixture/download.html

软件安装

使用conda进行软件安装.

conda install admixture

安装完成之后, 键入admixture, 显示如下信息, 说明安装成功

(base) [dengfei@localhost test]$ admixture **** ADMIXTURE Version 1.3.0 ******** Copyright 2008-2015 ******** David Alexander, Suyash Shringarpure, ******** John Novembre, Ken Lange ******** ******** Please cite our paper! ******** Information at www.genetics.ucla.edu/software/admixture ****Usage: admixture See --help or manual for more advanced usage.

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