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RSS订阅原创 WhichCells函数寻找某些非常规名称的基因
于是我又试了试才发现这个基因的全名是 "rna_Grin1"。所以带有 “rna_” 的基因比如 "rna_Grin1" 即使只输 "Grin1" 也能画出来，且图上标注为 "Grin1" 而不是 "rna_Grin1"。另外，使用该函数还可以找到表达多个基因的细胞，比如当你想要查看表达不同细胞类型的marker基因的细胞时就可以使用 WhichCells。后来我又试了用FeaturePlot()函数作图只输入 "Grin1"，图上标注还是为 "rna_Grin1"（此处不展示了）。
2023-06-21 21:33:45
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原创 基础数理统计
MASS包中，fitdistr()函数使用极大似然估计来拟合单变量数据的分布，它根据随机数和指定分布类型来估计随机数参数。MASS包，mvrnorm()可生成多元正态分布的随机数。一般可看成一个矩阵：行表示样本数量，列表示随机数的维度。kde2d()可估计二元正态分布的核密度（概率密度函数）一维随机数，一个向量。
2023-06-14 22:27:25
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原创 数据管理和探索 (R)
3）中位数绝对偏差(mad)：度量数据相对于中位数的离散情况。2）中位数：数据不服从正态分布使用更有效。4）变异系数：度量观测数据的标准差。1）平均值：数据服从正态分布。相对于平均值的离中趋势。
2023-06-07 22:30:02
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原创 数据管理与探索 (R)
3) min-max标准化（0-1标准化）：变量减去它的最小值然后除以它的最大值和最小值的差。createFolds(data$var, k=3) 数据均分为3粉的索引。2) 数据标准化：变量减去它的平均值然后除以它的标准差。宽型数据转化为长型数据：gather() 函数。长型数据转化为宽型数据：spread() 函数。长型数据转化为宽型数据：dcast() 函数。宽型数据转化为长型数据：melt() 函数。2) 使用 carte包按比例切分数据。1) 数据中心化：变量减去它的平均值。
2023-06-06 13:51:21
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原创 GEO数据挖掘
输入数据输入数据是**数值型矩阵/数据框**颜色的变化表示数值的大小实验目的：实验目的：通过基因表达量数据的差异分析和富集分析来解释生物学现象组别设计流程：不同处理 – 差异基因 – 找功能、找关联、找机制、同一通路有多个基因表达变化 – 解释差异，缩小基因范围流程：基因表达芯片的原理探针的表达量代表基因的表达量分析思路。
2023-04-21 03:05:39
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空空如也
空空如也
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