整理自生信技能树小洁老师授课内容
图表介绍
热图
- 输入数据输入数据是**数值型矩阵/数据框**
- 颜色的变化表示数值的大小
热图类别
- 相关性热图
- 差异基因热图
1. 散点图
2. 箱线图
- 输入数据是一个连续型向量和一个有重复值的离散型向量 即 分类变量
- 图解:包括 min max median 25% 75% 离群点
- 单个基因在两组之间的表达量差异
3. 火山图
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横坐标:logFC,纵坐标:-log10(P.value)
FoldChange (FC):处理组平均值 对照组平均值 logFC:Foldchange 取 log2
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理解 logFC,一定是**处理组-对照组**
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logFC 一般 <20 才正常