R语言的综合应用

数据内容整理自生信技能树课程

1. 玩转字符串

stringr包

字符串长度	str_length()
字符串拆分	str_split()
按位置提取字符	str_sub()
字符检测	str_detect()
字符替换	str_replace() / str_replace_all()
字符删除	str_remove() / str_remove_all()

注意：
str_length() 包含空格
区分字符和字符串

2. 玩转数据框

排序	arrange()
去重复	distinct()
数据框新增列	mutate()

test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
rownames(test) =NULL # 去掉行名，NULL是“什么都没有”
test

1.arrange() 

# arrange，数据框按照某一列排序，列于列的对应关系不变（同一行不变）
library(dplyr)
arrange(test, Sepal.Length) #从小到大
arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小

2.distinct()

# distinct，数据框按照某一列去重复
distinct(test,Species,.keep_all = T) #保留其它
distinct(test,Species)

3.mutate()

# mutate，数据框新增一列
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) #名字为new，内容为等号右侧
test

连续的步骤

%>% 管道符号，向后传递

iris %>%       # %>% 管道符号，向后传递
  select(-5) %>%
  as.matrix() %>%
  head(50) %>% 
  pheatmap::pheatmap()

3. 条件和循环

一）条件语句

if(1个逻辑值){ }

1. 只有if没有else，那么条件是FALSE时就什么都不做
2. 有else

#理解
i = 1
ifelse(i>0,"+","-") # 条件判断，yes，no

3. 多个条件

ifelse(i>0,"+",ifelse(i<0,"-","0"))

二）for循环

for(i in x){ }

	对x里的每个