cytoscape使用方法_Cytoscape使用方法

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Providing advanced genomic solutions

Cytoscape Quick Start

1.

安装

JDK1.6

32

位下载地址：

http://javadl.sun.com/webapps/download/AutoDL?BundleId=83383

64

位下载地址：

http://javadl.sun.com/webapps/download/AutoDL?BundleId=83385

2.

安装

Cytoscape2.8.3

下载下址：

http://www.cytoscape.org/download.html

3.

打开

Cytoscape

软件，根据菜单导入

*.ppi.txt

文件数据：

File

—

> Import

—

> import network from table

(

Text/MS Excel

)会弹出导入文件的对话框，

在对话框中做设置如下：

(

1

)

Input file:

选择文件路径

(

2

)

Source interaction: column 1

(

3

)

Target interaction: column 2

(

4

)

Preview:

单击

column 3

，此列会变绿，说明此列已可用

(

5