怎么将传感器测量的数据上传_会了GEO数据下载,来看看怎么上传吧

21d29dbbdd5fe581866e03ff46471633.png738724fa667b12059f09d3ee9bd584f9.png 今天是生信星球陪你的第703天21d29dbbdd5fe581866e03ff46471633.png


   大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~

   就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~

   这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!

豆豆写于2020.8.12
第一次接触这个操作,下午跟着官网学习了下

果然,还是看官网的帮助文档最香~

1 注册NCBI GEO账号

先注册NCBI账号,在:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

然后注册GEO账号,在:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/

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GEO可上传的数据类型种类主要集中在芯片和高通量数据,比如芯片数据的四大主流:Affymetrix、Agilent、Nimblegen、Illumina,高通量的RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等。另外还有RT-PCR、SAGE数据可以上传

2 提交高通量测序数据须知

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重点需要提交三部分:

实验总览(metadata spreadsheet):参考样本 

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/examples/seq_template.xlsx

处理过后的数据(processed data files)

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