今天是生信星球陪你的第703天
大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~
就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~
这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!
豆豆写于2020.8.12
第一次接触这个操作,下午跟着官网学习了下果然,还是看官网的帮助文档最香~
1 注册NCBI GEO账号
先注册NCBI账号,在:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
然后注册GEO账号,在:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/
![c44d9052d30c64566e53c072649003fd.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/715d011dc285f8bd12396d46b3d23dd1.png)
GEO可上传的数据类型种类主要集中在芯片和高通量数据,比如芯片数据的四大主流:Affymetrix、Agilent、Nimblegen、Illumina,高通量的RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等。另外还有RT-PCR、SAGE数据可以上传
2 提交高通量测序数据须知
![264ceeee27b8a3ce2360bc94dfe94d93.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/914b969fe3e6a56a5660cda14a8dea83.png)
重点需要提交三部分:
实验总览(metadata spreadsheet):参考样本
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/examples/seq_template.xlsx
处理过后的数据(processed data files)