使用itksnap进行图像配准后,直接save图像发现还是原图,查阅资料https://layerfmri.com/2019/02/11/high-quality-registration/ ,发现可以先导出transformation文件,然后利用ANTs(Advanced Normalization Tools)生成配准后的图像(ANTs只能基于linux或mac系统)。
1.导出transformation文件
itksnap的配准选项框右下角有个save,保存后是txt文件,也就是transformation文件。
2.安装ANTs
ccmake,gcc/g++,git是必须要的,itk有的说要安装,有的没说,我选择没安装。
ANTs安装可以参考这篇,https://blog.csdn.net/guipeng999/article/details/108237136?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2defaultbaidujs_utm_term~default-0.no_search_link&spm=1001.2101.3001.4242,以及官方文档https://github.com/ANTsX/ANTs/wiki/Compiling-ANTs-on-Linux-and-Mac-OS#get-the-latest-code,需要注意的是:</