raise DGLError('DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following\n\n'
dgl._ffi.base.DGLError: DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following
dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)
, which creates a new DGLGraph from the networkx graph.
问题代码在这行。
g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True).from_networkx(g_nx, node_attrs = None, edge_attrs = 'type')
本来代码是这样的(上下面这两段代码报错都是这个)
g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True)
g_dgl.from_networkx(g_nx, edge_attrs=['type'])
#################################################################
# DEPRECATED: from the old DGLGraph
#################################################################
def from_networkx(self, nx_graph, node_attrs=None, edge_attrs=None):
"""DEPRECATED: please use
``dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)``
which will return a new graph created from the networkx graph.
"""
raise DGLError('DGLGraph.from_networkx is deprecated. Please call the following\n\n'
'\t dgl.from_networkx(nx_graph, node_attrs, edge_attrs)\n\n'
', which creates a new DGLGraph from the networkx graph.')
一开始看到这个报错把注意力集中到node_attrs=None变成node_attrs上了,以为是必须要带参数的原因。
由于dgl知识并不熟悉,而且这是复现的SumGNN模型,对其中的逻辑只看懂了大概
于是回头学习dgl官方文档,代码在服务器上不知道怎么调试,从头开始把代码读了一遍,也没感觉到这样写有什么不对。很懵,前后看了两三天也不知道问题出在哪里,然后和师兄讨论,问了同学,可能是版本的问题,但是我降了版本发现也是一样的问题,后来同学发现是dgl.from_networkx这个要用dgl直接调用,
重点是dgl直接调用,
而前面的是先创建一个dgl图,用这个dgl图再来调用,如下所示,这就是不对的,这就是用g_dgl调用的,应该直接dgl.from_xxx,有很多同学来找我问这个问题,请看清楚先哦
另外如果是为了复现SUMGNN的话,可以直接将版本降到0.4.3,就没有这个报错了。
g_dgl = dgl.DGLGraph(multigraph=True)
g_dgl.from_networkx(g_nx, edge_attrs=['type'])
希望以后遇到这类问题的时候一定不能陷入思维误区,多想一想其他的出现错误的可能。哪怕对背景知识不了解也没关系
这个错耽误太多时间了。。。