GRAPHCARE：双向图神经网络 + 个性化知识图谱 + 大模型，医疗保健预测领域
  • 关系图
  • 双向图神经网络
  • 个性化知识图谱
  • GRAPHCARE框架
  • 创意视角
  • 如果取消双向图神经网络，直接用医学大模型分析，还能做医疗保健预测领域吗？
  • 使用双向图神经网络（BAT GNN）
  • 直接使用医学大模型
  • 对比



 

论文： GRAPHCARE: ENHANCING HEALTHCARE PREDICTIONS WITH PERSONALIZED KNOWLEDGE GRA

关系图

GRAPHCARE：双向图神经网络 + 个性化知识图谱 + 大模型，打开医疗保健预测领域之门_语言模型


GRAPHCARE框架是一种先进的医疗预测系统，它通过结合患者的电子健康记录（EHR）和丰富的医学知识图谱来提供个性化的医疗预测。下面我将详细介绍这个框架的工作原理和各个组成部分。

首先，GRAPHCARE框架的核心是构建患者特定的知识图谱，这些图谱基于两个主要来源：大型语言模型（LLMs）和现有的外部生物医学知识图谱。

大型语言模型能够从海量的生物医学文献中提取关键的医学知识，而外部知识图谱则提供了一个结构化的信息网络，包含了众多医疗概念及其相互关系。

知识提取是框架中的第一步，它通过两种方式进行：

  1. LLMs提取：利用大型语言模型从开放世界数据中提取医学知识。
  2. 子图采样：从现有的生物医学知识图谱中采样相关子图，以补充和丰富知识库。

接下来，这些知识需要经过节点和边聚类来精炼，这一步骤通过计算节点和边的相似性，将相似的节点和边聚集在一起，形成一个更加紧凑和有意义的知识结构。

一旦我们有了精炼后的知识图谱，下一步就是个性化知识图谱组合。

这一步骤将不同的医疗概念，如疾病、治疗和药物，与患者的具体医疗记录相结合，形成一个全面的患者特定图谱。

为了使这个图谱对预测有用，GRAPHCARE框架采用了一种特殊的图神经网络——BAT图神经网络。

这个网络使用双注意力机制来识别和突出图中最重要的节点和关系，这些节点和关系对于预测患者的健康状况至关重要。

在患者图组成的过程中，框架不仅考虑了单个医疗事件，还将患者的多次医疗访问连接起来，形成一个随时间变化的动态图谱。这种考虑时间序列的方法使模型能够捕捉到患者健康状况的长期趋势和短期变化。

此外，GRAPHCARE框架还涉及到患者表示学习，它通过三种方式来表示患者信息：

  1. 患者节点：直接与患者的医疗记录相连的节点。
  2. 患者图：通过图谱中的节点和边来综合表示患者的整体医疗情况。
  3. 联合嵌入：将患者节点和患者图的信息结合起来，形成一个更全面的表示。

最后，所有这些信息都被输入到一个多任务学习模型中，该模型可以同时处理多个医疗预测任务，如死亡率预测、再入院预测、住院时间预测和药物推荐等。

通过这种方式，GRAPHCARE框架能够提供一个综合考虑患者历史、当前状况和医学知识深度的个性化医疗预测服务，帮助医生和医疗专业人员做出更准确和及时的医疗决策。

双向图神经网络

GRAPHCARE：双向图神经网络 + 个性化知识图谱 + 大模型，打开医疗保健预测领域之门_数据_02

BAT图神经网络是GRAPHCARE框架中用于医疗预测的核心组件。

它通过以下步骤实现对患者个性化知识图谱的深入分析：

  1. 双注意力机制：BAT GNN利用“双注意力机制”，包括“节点级注意力”和“访问级注意力”，以突出患者图中关键的医疗事件和节点。
  2. 图卷积层：模型采用“图卷积层”来更新节点表示，该层结合了注意力权重和边权重，允许模型学习患者电子健康记录数据的丰富表示。
  3. 注意力初始化：为了提高模型的收敛速度和预测准确性，BAT GNN使用基于大型语言模型的“注意力初始化”方法，将先验知识融入到注意力权重的初始化中。
  4. 患者表示学习：BAT GNN能够通过三种类型的患者表示——“患者节点”、“患者图”和“联合嵌入”——来处理多种医疗保健预测任务。
  5. 多任务学习：模型通过“多任务学习”框架，能够同时对死亡率、再入院、住院时间（LOS）和药物推荐等关键医疗保健预测任务进行训练和预测。
个性化知识图谱

个性化知识图谱是GRAPHCARE框架中的一个关键组成部分，它通过以下步骤从患者电子健康记录（EHR）数据中生成：

  1. 概念特定知识图谱生成：首先，GRAPHCARE通过从大型语言模型（LLMs）和现有的生物医学知识图谱中提取知识，为每个医疗概念生成“概念特定知识图谱”。
  2. 节点和边聚类：接下来，GRAPHCARE对所有生成的概念特定知识图谱中的节点和边进行“节点和边聚类”，以创建一个更聚合的知识图谱。
  3. 个性化知识图谱组合：然后，GRAPHCARE通过合并与患者相关的所有概念特定知识图谱，并结合患者的顺序访问数据，构建每个患者的“个性化知识图谱”。
  4. 患者图组成：最后，GRAPHCARE将个性化知识图谱与患者的医疗事件相结合，形成一个包含时间序列数据的“患者图”，这个图谱能够反映患者的医疗历程和健康状况。

通过上述步骤，GRAPHCARE能够为每个患者生成一个全面、个性化的知识图谱，该图谱随后被用于BAT GNN进行精确的医疗预测。

GRAPHCARE框架

GRAPHCARE：双向图神经网络 + 个性化知识图谱 + 大模型，打开医疗保健预测领域之门_神经网络_03

  1. 概念特定知识图谱生成：
    假设我们有一个患者，其医疗记录中包含“糖尿病”和“高血压”两种疾病，以及“胰岛素治疗”这一治疗程序。首先，GRAPHCARE会为“糖尿病”和“高血压”这两个医疗概念各自生成一个概念特定知识图谱。这通过从大型语言模型（LLM）中提取相关知识，以及从现有的医学知识图谱中采样子图来完成。
  2. 节点和边聚类：
    接下来，系统对这些知识图谱中的节点（如疾病、治疗方式）和边（如疾病与治疗方式之间的关系）进行聚类，以创建更为综合的表示，并简化知识图谱的结构。
  3. 患者图组合：
    然后，GRAPHCARE将这些概念特定知识图谱与患者具体的医疗事件（如药物使用记录、病情进展）结合起来，构建出一个患者特定的图谱。这个图谱不仅包含患者的当前状况，还包含其医疗历史。
  4. 患者图的时序性：
    考虑到患者可能有多次就诊记录，GRAPHCARE会将这些记录按照时间顺序整合到患者图中，形成一个包含时间序列数据的动态图谱。
  5. 双注意力增强GNN模型应用：
    利用患者图，GRAPHCARE采用双注意力增强的图神经网络模型进行分析。这个模型会识别出患者图中最重要的节点和访问记录，例如，对于糖尿病患者，模型可能会特别关注与血糖控制相关的节点。
  6. 患者表示学习：
    系统会从患者图中学习到三种类型的患者表示：患者节点嵌入可能关注于患者的基本信息；患者图嵌入可能包含患者整体医疗状况的表示；联合嵌入则可能结合了上述两种信息。
  7. 医疗预测：
    最后，基于这些患者表示，GRAPHCARE可以进行多种医疗预测任务，例如预测患者未来30天内的再入院风险、估计患者的住院时间、推荐合适的药物等。

我们可以看到GRAPHCARE如何将患者的医疗记录转化为一个结构化的知识图谱，并利用这个图谱进行深入的医疗分析和预测。

创意视角
  1. 组合创新：
  • 结合GRAPHCARE框架与新兴技术，例如人工智能的其他分支（如强化学习或自然语言处理），以增强知识图谱的生成和分析能力。
  1. 拆开创新：
  • 将GRAPHCARE的各个组件（如知识提取、图谱构建、GNN模型）独立出来，作为模块化服务提供，允许其他系统或研究根据需要选择性集成。
  1. 转换创新：
  • 将GRAPHCARE框架中的知识图谱技术应用于非医疗领域，比如金融风险评估或供应链优化。
  1. 借用创新：
  • 借鉴其他领域的算法或模型来改进GRAPHCARE的现有组件，例如采用物理学中的网络动力学理论来优化图神经网络的结构。
  1. 联想创新：
  • 通过跨学科的联想，将GRAPHCARE与社会学、心理学等领域结合，以更全面地理解患者行为和医疗结果。
  1. 反向思考创新：
  • 探索不使用传统电子健康记录数据，而是利用可穿戴设备收集的实时生理数据来训练和优化GRAPHCARE模型。
  1. 问题创新：
  • 深入分析当前GRAPHCARE未能解决的医疗预测问题，如罕见病的早期诊断，从而推动模型的进一步创新和发展。
  1. 错误创新：
  • 从GRAPHCARE模型训练和预测过程中的错误中学习，探索这些错误背后的模式和原因，以改进模型的鲁棒性和准确性。
  1. 感情创新：
  • 在GRAPHCARE的输出（如患者教育材料或医疗建议）中融入更多情感智能，以提高患者对医疗建议的接受度和依从性。
  1. 模仿创新：
  • 模仿自然界中的自适应和进化机制，改进GRAPHCARE框架中的自适应学习能力，使其能够根据新的数据和反馈自动优化。

接下来，我们可以基于几个关键标准对这些创新点进行比较和选择：

  • 创新性：创新点是否提供了全新的视角或方法，与现有解决方案相比有多大的不同。
  • 可行性：创新点是否在当前技术条件下可行，需要多少资源和时间来实现。
  • 影响：创新点对提高医疗预测的准确性、效率或用户体验的潜在影响。
  • 成本效益：创新点的实施成本与预期收益的比较。
  • 伦理和合规性：创新点是否符合医疗行业的伦理标准和法律法规。

如果取消双向图神经网络，直接用医学大模型分析，还能做医疗保健预测领域吗？

如果取消双向图神经网络（BAT GNN）并直接使用医学大型语言模型（LLMs）进行分析，理论上仍然可以进行医疗保健预测，但方法和效果可能会有所不同。以下是两种方法的对比：

使用双向图神经网络（BAT GNN）
  1. 结构化数据分析：BAT GNN能够处理结构化数据，特别是图结构数据，它可以捕捉患者医疗记录中不同实体（如疾病、药物、治疗）之间的关系和相互作用。
  2. 注意力机制：通过节点级和访问级注意力机制，BAT GNN能够识别和强调患者医疗记录中最重要的部分，为预测提供关键信息。
  3. 多任务学习：BAT GNN可以同时处理多个医疗预测任务，提高模型的泛化能力和效率。
  4. 个性化预测：利用个性化知识图谱，BAT GNN能够为每个患者提供定制化的预测。
  5. 解释性：图神经网络的层级结构和注意力权重可以提供一定程度的解释性，帮助理解模型的预测决策。
直接使用医学大模型
  1. 文本处理能力：LLMs擅长处理和理解自然语言文本数据，能够从临床笔记、医生的报告等非结构化文本中提取信息。
  2. 上下文理解：LLMs能够理解文本中的上下文信息，提供对患者状况的全面理解。
  3. 预训练知识：LLMs通常在大规模数据上预训练，拥有广泛的医学知识，可以用于直接回答问题或生成文本。
  4. 灵活性：LLMs可以灵活地应用于各种任务，包括但不限于医疗保健预测。
  5. 解释性挑战：相比于GNN，LLMs的决策过程通常被认为是黑盒，提供模型预测的解释性可能更具挑战性。
对比
  • 数据处理：BAT GNN更适合处理图结构数据，而LLMs更适合处理文本数据。
  • 预测能力：GNN通过结构化分析可能提供更精确的医疗预测，而LLMs可能在理解复杂上下文方面表现更好。
  • 个性化：BAT GNN通过个性化知识图谱提供定制化预测，而LLMs可能需要额外的定制化训练来实现这一点。
  • 解释性：BAT GNN可能提供更好的解释性，因为它的注意力机制可以展示模型关注的医疗记录部分，而LLMs的解释性通常较差。
  • 应用范围：LLMs的应用范围可能更广，因为它们可以处理多种类型的语言任务。

双向图神经网络（BAT GNN）是一种专门处理图结构数据的算法，能够捕捉医疗记录中的复杂关系，为个性化医疗预测提供支持。

而医学大模型（LLMs）则擅长理解和处理自然语言文本，能够从非结构化医疗数据中提取深层次的洞见。

综上所述，虽然取消BAT GNN并使用LLMs仍然可以进行医疗保健预测，但可能会牺牲一些结构化数据处理和个性化预测方面的优势。