【方法篇】通过标记手段分析蛋白N-肉豆蔻酰修饰

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蛋白标记手段在研究和辨别蛋白发生修饰类型实验中有重要作用。

此篇介绍的是被称为肉豆蔻酰化的蛋白翻译后修饰位点,肉豆蔻酰化是一种由肉豆蔻酰CoA(后文简称NMT)催化的反应,将肉豆蔻酸(C14饱和脂肪酸)转移到蛋白质N端的反应。大肠杆菌是内源性不含有NMT,用来共表达NMT和被标记的目标蛋白,含有一个可以进行豆蔻酸反应的“点击”标签,此标签是一个功能集团,可以通过“点击”化学反应,例如叠氮化合物,可作为体外特异性位点标记的“手柄”。在此方法中提供了体内重组蛋白N端标记的实验方案,以及通过点击化学方法,可对蛋白进行亲和纯化和荧光检测。除了一般的N端蛋白标记外,此方法还可以用于研究相关蛋白本体豆蔻酰修饰,NMT酶的特异性,整个方法都无需放射性同位素。

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图1

通过采用特异性和选择性方式标记蛋白质的手段是非常实用的,当然能够通过这样的方法确认蛋白所发生的修饰位点也是同样的。比如糖基化修饰、生物素结合、异戊二酰化、胆固醇化、磷酸化和脂质化等。此文中的方法采用了实用细菌作为转移酶表达的容器,随后目标蛋白和体内的天然小分子转移酶底物的化学标记模拟,如图1所示。此方

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