微生物数据处理—Microbiomeanalyst在线分析

ZOTU表处理方法参见本人前述zotu流程

1 OUT表准备

用excel打开文件zotutab.vsearch.count_table，第一列列名改为#NAME，第二列删除

         

文件另存为csv格式文件

2 准备meta文件

Excel新建一个表格，第一列是样品名，第二列是处理分组信息，文件另存为csv格式

3 准备物种注释文件

用Excel打开zotus1.nr_v138.wang.taxonomy,选中第二列，替换，查找内容输入(*)，点全部替换

选中第二列，数据→分列→分隔符号，选分号，完成

在表格最上插入一行，A1到G1分别输入

#Taxonomy

Kindom

Phylum

Class

Order

Family

Genus

文件另存为csv文件

4 准备tre文件

把文件clusters.tree改名clusters.tre

5上传分析

打开网站https://www.microbiomeanalyst.ca/MicrobiomeAnalyst/upload/OtuUploadView.xhtml

分别上传上述4个文件

提交后，点右下Proceed

一直点提交，处理，最后结果就出来了