NV生物信息平台bencmark安装过程

问题描述:

Cmake 指定高版本的gcc可以编译通过项目，但是不带测试实例，如果要安装测试实例官网

给的编译参数是:

-Dgw_enable_benchmarks=ON

但是使用完以后并没有生成相应的测试程序只生成了readme，将make过程打印出来后可以看到readme的路径。

进行cmake定位发现是否生成benchmark的测试程序是有一个if判断:

再次定位这个变量:

只有当cga_enable_benchmarks为真的时候才会将enable_benchmarks设置为ON从而构建benchmark的测试程序。添加CMAKE参数，果然跟之前的过程不同，但是报错了。

再次进到CMAKE程序里定位:

可以看到当这三个变量都是假的时候，打印出这个报错，但是再往后就定位不到问题了。

采取方案二:

先不构建这个测试实例，而是先安装工程，最后手工安装测试实例。

修改一下cmake文件，尝试build成功。生成了测试程序，但是运行报错。如下

百度后，说是需要将/lib64/libstdc++.so.6链接到新版的动态链接库，先用下面命令查找相应的标准库。

find / -name "libstdc++.so*"

应该使用红色的，删除原有的软连接，将/lib64/libstdc++.so.6挂到红色的地址，再次运行测试程序成功！！！！！！！！

思考

之前报错下面三个变量都找不到，会不会也是在老版本的动态库中，没有定义这三个宏呢，试了下，将生成后的测试程序删除掉，再次安装成功！！！！，证明之前的问题都是因为使用了旧的动态链接库。