code iban 是有什么组成_什么是分子描述符

本文的撰写参考过很多资料，基本上参考的都在文章列出了（详情见参考资料列表），但是不是一一对应的，请见谅！

什么是分子描述符

定量构效关系（quantitative structure-activity relationship,QSAR）是化学计量学的重要工具，它采用数理统计方法解释化合物活性或物理化学特征与其分子结构之间的定量变化规律。自上世纪80年代以来，由于方法学和计算科学的飞速发展，特别是高通量筛选，积累了大量生物活性数据，使QSAR研究广泛应用于生命科学、环境科学等领域。

分子描述符的计算是QSAR研究的基础，精确定义并且合理使用分子描述符在QSAR研究中非常重要。能否得到具有较高信度和效度的QSAR模型很大程度上取决于选择的描述符是否正确。目前，各种软件提供提供的分子描述符已经超过5000多种。因此，如何从中选择出于研究对象最密切相关的，成为QSAR研究中首先要面对的问题。文献提及的描述符选择方法，主要有逐步回归（SR）、主成分分析（PCA）、因子分析（FA）以及偏最小二乘法（PLS）等。

所谓分子描述符，是指分子在某一方面性质的度量，既可以是分子的物理化学性质，也可以是根据分子结构通过各种算法推导出来的数值指标。随着计算方法的日趋成熟，已经有多本关于分子描述符的专著或作为章节。

分子描述符简介与分类

分子描述符可以有多种分类方式，可以粗略分为如下图所示的样式。

分子描述符可以分为定量描述符和定性描述符。定量描述包括基于分子图论、各种理论或实验光谱数据（如紫外光谱）、分子组成（如氢键供体数、化学键数）、理化性质（如酯水分布系数）描述符、分子场描述符以及分子形状描述符等；定性描述符一般称为分子指纹，即将分子的结构、性质、片断或子结构用某种编码来表示，常用的分子指纹包括Daylight fingerprints、MACCS keys、MDL、public keys等。

根据描述符的数据类型，分子描述符又可以分为布尔值（如是否手性）、整数（如环数）、实数（如分子量）、向量（如偶极矩）、张量（如电子极化率）、标量场（如静电式）、向量场（如静电势梯度）等类型。

依据描述符计算所需的分子结构维数，分子描述符还可以分为一维、二维、三维等。

此外，针对不同的计算体系，分子描述符还有其他分类标准，比如Dragon软件，根据描述符物理意义的差异可划分为组成描述符、分子性质描述符、拓扑描述符、几何描述符等20个模块，每个模块的描述符分别代表不同的化学信息。

一般选择合适分子描述符的要求：（1）具有结构解释性；（2）与至少一种性质具有良好的相关性；（3）具有区分异构体的优势；（4）能够应用于局部结构；（5）独立性好；（6）简洁；（7）不是基于实验性质；（8）与其他描述符不相关；（9）可以有效构建；（10）使用熟悉的结构概念，（11）具有正确的大小依赖性；（ 12）随结构的改变而变化。

分子描述符计算工具

当前已有许多用于计算分子描述符的商业和免费提供的软件。其中一些是专门为分子描述符的计算而开发的（如：BlueDesc、CDK Descriptor 、DRAGON、MODEL等），也有一些QSAR软件具有计算分子描述符的功能（如： CODESSA Pro, Discovery Studio, Sybyl, MOE），此外，还有一些开源库，例如JOELib、Chemistry Development Kit (CDK)也提供了计算分子描述符的功能。

分子描述符的计算可以通过Dragon、PowerMV等专门的描述符计算软件实现，也可使用Sybyl、Cerius2等分子模拟软件包中有关描述符计算的模块。

分子描述符计算软件比较多，这里不一一赘述，简单列举一下：

Dragon、MoDEL、MolGen、Cerius2、Sarchitect、PreADMET、ADRIANA.Code、ADMET Predictor、MOE、Joelib、ADAPT、SYBYL、PowerMV、CODESSA、Pipeline Pilot、SARNavigator等等

参考资料

1. 任伟, 孔德信. 定量构效关系研究中分子描述符的相关性[J]. 计算机与应用化学, 2009(11):87-90.
2. 药物设计工具之QSAR。https://mp.weixin.qq.com/s/6YeAHrPWsHzidy4Zbc5gjQ
3. 解析分子结构和分子指纹的工具PaDEL‐Descriptor。https://mp.weixin.qq.com/s/u-xUHgKHLi_bx6nIVYGIuA

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