r语言热图对列不进行聚类_数据可视化 - 热图·R

最新推荐文章于 2022-12-01 13:21:51 发布

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文章标签： r语言热图对列不进行聚类

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42566209/article/details/112350063

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本文介绍了如何使用R语言的pheatmap包来绘制热图，重点在于不进行列聚类的设置。通过基本参数用法和添加样本、变量分类信息，展示了创建热图的过程。

摘要由CSDN通过智能技术生成

热图（如下图所示），是一种展示样本与差异变量关系的可视化方式，可以通过R/python进行绘制。本文主要分别具体介绍如何使用R实现热图绘制。

R绘制热图

通常调用R的软件包“pheatmap”来进行热图绘制。

# 软件包安装
install.packages("pheatmap")

# 热图绘制
# 先准备好一个数据矩阵matrix.csv，行row为变量，列col为样本。
library('pheatmap')
data=read.table('matrix.csv',sep = ',',stringsAsFactors = F, header =T,row.names = 1)
pdf('heatmap.pdf',height=11,width=12)
pheatmap(as.matrix(data),cluster_cols = F,cluster_rows = F,color = colorRampPalet