R语言微生物群落稳定性AVD指数代码

下面是计算AVD指数的R代码：

library(vegan)

# 读入微生物群落数据
data <- read.table("microbial_community_data.txt", header = TRUE)

# 计算抽样间的bray-curtis距离矩阵
bc_dist <- vegdist(data, method = "bray")

# 计算AVD指数
AVD <- anosim(bc_dist)

# 打印AVD指数结果
AVD

这段代码需要先安装vegan包，然后读入微生物群落数据，使用vegdist函数计算bray-curtis距离矩阵，最后使