R语言做GGEbiplot_GGE模型分析品种稳定性

GGE模型分析品种稳定性

GGE Biplot介绍

GGE英文全称:genotype main effects and genotype × environment interaction。

双标图能够同时考虑G(品种表现)和GE(品种与环境互作),可以有效地评价品种、试点和划分生态区域,已被广泛应用于不同作物中。

GGE biplot在Genstat中是基于菜单操作的,简单方便,因此在多环境试验中应用较多。R语言中的GGEBiplot包也可以做GGE分析,但是它不能分析缺失数据,而缺失数据在农业生成中经常遇到,因此GGE双标图更多的使用GenStat进行分析。

双标图应用领域:

品种——环境两向表

做基因表达数据

QTL效应——环境两向表

品种——性状两向表

双列杂交两向表

寄主——病原物两向表

基因型——遗传标记数据

环境条件——作物性状两向表

试验地点——气候土壤因素两向表

数据

现有18个品种(G1 ~ G9),9个地点(e1 ~ e9),观测值为每个品种在每个地点的BLUP值(或者平均值)。

模型选择

在模型中选择GGE Biplot对话框,在Y-variate中导入产量数据,在Genotype中导入品种数据,在Environments中导入地点数据。点击Run,运行模型。

结果解读

品种的适应性

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