MKTOP力场生成工具的使用

1.文件下载

2.解压,之后更改路径

vi mktop.pl
更改Gromacs路径
$gromacs_dir="/software/gromacs-2022.5/share/top/";

3.第一次使用:chmod u+rxw mktop.pl

4.输入文件有input.pdb and charges.txt文件只能识别pdb文件结构

5.执行命令

mktop_2.2.1.pl -i input.pdb -c charges.txt -o topology.top -ff opls

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