MKTOP力场生成工具的使用

最新推荐文章于 2024-10-06 11:52:56 发布

四年级二班

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文章标签： linux 运维服务器

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43011746/article/details/135196423

版权

1.文件下载

2.解压，之后更改路径

vi mktop.pl
更改Gromacs路径
$gromacs_dir="/software/gromacs-2022.5/share/top/";

3.第一次使用：chmod u+rxw mktop.pl

4.输入文件有input.pdb and charges.txt文件只能识别pdb文件结构

5.执行命令

mktop_2.2.1.pl -i input.pdb -c charges.txt -o topology.top -ff opls

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