lammps运行报错以及GPU的效率测试

报错内容：LAMMPS (23 Jun 2022 - Update 4)
Reading restart file ...
  restart file = 12 Dec 2018, LAMMPS = 23 Jun 2022
WARNING: Old restart file format revision. Switching to compatibility mode. (../read_restart.cpp:613)
WARNING: Restart file used different # of processors: 64 vs. 4 (../read_restart.cpp:658)
WARNING: Restart file used different newton pair setting, using input script value (../read_restart.cpp:685)
  restoring atom style full from restart
  orthogonal box = (19.934261 19.927718 19.876779) to (80.082311 80.075768 80.024829)
  1 by 2 by 2 MPI processor grid
  restoring pair style hybrid from restart
ERROR: Unrecognized pair style '' (../force.cpp:279)
Last command: read_restart    restart.equil

解决方法：lammps的版本不兼容restart文件

报错2：ERROR on proc 0: Potential file does not match AIREBO/REBO style variant: # AIREBO : # Cite as S. J. Stuart, A. B. Tutein, J. A. Harrison,
 (../pair_airebo.cpp:3386)
Last command: pair_coeff      * * airebo CH.airebo NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL NULL C

解决方法：用了新的lammps跑旧的代码，去githup下载一个新的就可以

报错三：mpirun -np 4 lmp_mpi -in **_**_ev.in1 >out.log CPU可以运行

但是

mpirun -np 4 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out.log

不可以运行

报错：Cuda driver error 4 in call at file 'geryon/nvd_timer.h' in line 99.

ERROR: Must not use GPU neighbor lists with hybrid pair style (../fix_gpu.cpp:283)

解决方法：提交命令加入neigh no

mpirun -np 4 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out.log

成功运行

运行成功后测试一下运行速度：跑10000步，16120 atoms

mpirun -np 1 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out.log

CPU：1核；GPU：1个（40%利用率）运行时间：0:05:48

nohup mpirun -np 2 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out1.log &

CPU：2核；GPU：1个（39%利用率）运行时间： 0:03:23

nohup mpirun -np 4 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out1.log &

CPU：4核；GPU：1个（37%利用率）运行时间： 0:02:09

nohup mpirun -np 6 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out1.log &

CPU：6核；GPU：1个（87%利用率）运行时间：  0:01:41

nohup mpirun -np 8 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out1.log &

CPU：8核；GPU：1个（80%利用率）运行时间：  0:01:47

nohup mpirun -np 12 lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 neigh no -in litfsi_pdadma_ev.in1 >out1.log &

 CPU：12核；GPU：1个（80%利用率）运行时间：  0:01:49

综上所测试结果：6个CPU结合1GPU的搭配使得lammps运行速度达到最大