本文介绍了LigParGen软件如何生成基于OPLS-AA的Gromacs力场，强调了使用Chimera处理PDB文件的要求，以及在提交结构时必须选择的优化和充电模型选项，如1.14*CM1A或1.14*CM1A-LBCC。
LigParGen的功能：
能生成一下软件用的小分子立场
一般生成Gromacs的top力场是基于OPLS-AA力场
用法：输入的文件必须是Chimera软件打开后重新保存为pdb的文件，否则不会识别。
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Maximum ligand size allowed is 200 atoms.
在将结构提交到服务器之前，用户必须指定两个选项：优化和充电模型（1.14*CM1A 或 1.14*CM1A-LBCC）。优化将使用 OPLS-AA 和服务器生成的充电模型参数对提交的结构进行快速最小化。 如果提交的配体不是中性的，则只能应用CM1A模型（电荷必须由用户指定），并且不会使用比例因子1.14。 然后，用户可以提交结构并下载 Gromacs 文件
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