ADNI数据集介绍

http://blog.sciencenet.cn/blog-1969089-1046865.html
(1)ADNI 1:

开发改进的方法，为获取老年痴呆症(AD)、轻度认知障碍(MCI)和老年人对照患者的纵向、多位点MRI和PET数据制定统一标准
获得一般可访问的数据仓库，描述大脑结构和代谢的纵向变化，以及临床/认知和生物标志物数据，以验证影像学替代物
在涉及这些患者的试验中，开发出能够最大限度地确定治疗效果的方法
测试基于临床和生物标记数据的一系列假设

(2)ADNI GO:

通过招募200名AD症状最轻微的患者(EMCI)来定义和描述MCI之前的AD谱阶段
对ADNI1和新入组EMCI受试者的CN和LMCI受试者进行F18淀粉样蛋白成像。FDG PET将与F18淀粉样蛋白成像联合进行
建立一个全国性的F18淀粉样蛋白成像网络，测试关于脑淀粉样蛋白积累的流行程度和严重程度及其与临床状态、MRI、FDG-PET、CSF和ADNI1血浆生物标志物的变化的关系的假设
在基线、第3个月、第6个月和第12个月收集所有新入组的受试者的3T MRI
对来自ADNI1的约500名LMCI和认知正常的受试者进行纵向临床/认知和1.5T MRI研究，为期2年
收集和分析所有新入组的EMCI和随访受试者的血液和脑脊液生物标志物
采集血液样本进行DNA和RNA提取。新入组的受试者还将采集细胞永生化和APOE基因分型的样本

(3)ADNI 2:

随着病理的发展，确定阿尔茨海默氏病(AD)的临床、影像学、遗传和生化生物标志物特征之间的关系
为AD的神经科学提供信息，识别可用于临床试验的诊断和预后标记和结果度量，并帮助开发最有效的临床试验方案
制定统一标准，获取AD、MCI和老年人对照患者纵向多位点MRI和PET数据
对550名新入组的受试者进行纵向临床、认知、MRI、PET (18F-Florbetapir和FDG)和血液和脑脊液生物标志物研究，并对ADNI1和ADNI的约700名受试者继续这些研究5年
采集血液样本进行DNA和RNA提取。新入组的受试者还将采集细胞永生化和APOE基因分型的样本
通过参加尸检的ADNI1、ADNI GO和ADNI2参与者的神经病理学检查，验证临床诊断、影像学和生物标志物替代物

(4)ADNI 3：

认知和相关生物标志物的纵向变化
认知衰退的预测
通过将结果与标准的临床测量和病理学相关联，验证基线和纵向获得的生物标志物测量结果
确定注意认知下降和AV-1451 PET (tau PET)的最佳结果措施，认知下降的预测因子，认知正常参与者(二级临床前AD试验)、MCI患者(前驱症状AD试验)和AD引起的早期痴呆患者的临床试验的纳入/排除标准
确定在AD大脑和基因中发现的其他已知疾病蛋白以及新发现的基因、蛋白质和分析物的作用，这些分析物提供了关于AD发病/诊断的有用信息

ADNI1:
I. only sMRI;

II. scanns were scanned using either 1.5T or 3.0T scanner
ADNI2/GO:
I. sMRI, fMRI, and DTI. DTI scans are available only from ADNI 2/GO subjects who were scanned with a GE Systems MR Scanner.

II. All participants newly enrolled in ADNI2 are scanned using the 3T MRI scanning protocol.

III. ADNI2 participants are scanned at screening, 3 months from the screening MRI, and within two weeks before or after Month 6 and subsequent annual visits.
ADNI3:
Note: When searching the database for baseline or “Timepoint 1″ data, users should select both “screening” and “baseline” from the visit selection box.


ADNI中的扫描是在两种不同的特斯拉扫描仪上进行的，即飞利浦医疗系统和西门子
飞利浦医疗系统扫描的EPI序列为144个体积，场强=3.0特斯拉，翻转角=80.0°，TE=30.0ms，TR=3000.0ms，64×65矩阵，6720.0层厚度为3.31mm的静止状态fMRI
用飞利浦医学系统扫描仪进行扩展静息状态fMRI的EPI序列为:200体积,场强=3.0tesla,翻转角=90.0°,TE=30.0ms,TR=3000.0,64×65矩阵,9600.0层厚3.31mm
对于西门子扫描仪，EPI序列是197个体积，场强=3.0特斯拉，翻转角=80.0度，TE=30.0ms，TR=2999.99，448×448矩阵，以及197个3.4mm厚度的切片
（此处显示的信息与下载的经过处理的信息TE不一致）

5. DocumentSummary.csv文件中DXCHANGE的值及对应的状态：

   1=Stable: NL to NL;
   
   2=Stable: MCI to MCI;
   
   3=Stable: Dementia to Dementia;
   
   4=Conversion: NL to MCI;
   
   5=Conversion: MCI to Dementia;
   
   6=Conversion: NL to Dementia;
   
   7=Reversion: MCI to NL;
   
   8=Reversion: Dementia to MCI;
   
   9=Reversion: Dementia to NL