关于时间序列问题

按照 AAL 模板将大脑划分为 116 脑区后,再将每个被试的 175 个功能磁共振成像时间序列进行脑区内体素平均,如此,每个脑区对应一个平均时间序列,从而每个被试得到 116 个脑区的平均时间序列,对应 116×175 的矩阵。通过计算每个被试脑区间的皮尔逊相关系数,得到 116×116 功能连接矩阵,该矩阵中的每个元素都表示相应两个脑区之间的功能连接情况,其中正数表示两个脑区之间的功能连接正相关,负数表示两个脑区的功能连接负相关。详细的处理流程见图 3.4。不难得知,最终得到的功能连接矩阵是对称矩阵,如果取整个矩阵中的数据作为模式分析特征,则必然存在数据冗余,所以取矩阵的下三角数据作为模式分析的初始特征,共 6670 个。
答疑
图像预处理之后提取AAL模版的时间序列(dpabi可以做到) 会得到volume*116的矩阵 直接对这个矩阵做pearson相关就好了。
每个被试划分为116个脑区,每个脑区的时间序列有175的时间点,一个脑区对应多条时间序列,对这多条时间序列取平均后,每个脑区对应一个平均时间序列,即116条时间序列。对这116条时间序列两两相关做功能连接,得到的皮尔逊相关系数矩阵。矩阵只取上三角或下三角。
如何将AAL的116个脑区转为90个?
1 确定小脑内parcellation unit的编号
2 将那些值为上面那些编号的vocel找出来,将其置为0.

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马尔可夫时间序列问题是指通过马尔可夫模型对时间序列进行建模和预测的问题。马尔可夫模型是一种基于状态转移的概率模型,它假设当前状态只与前一个状态有关,与更早的状态无关。马尔可夫时间序列问题可以通过隐马尔可夫模型(HMM)来解决。 HMM是一种统计模型,用于描述由隐藏的离散状态控制的观测序列。在HMM中,时间序列被认为是由一系列隐藏的状态和对应的观测值组成。隐藏的状态之间存在转移概率,观测值与隐藏状态之间存在发射概率。通过学习这些概率,可以对未来的观测序列进行预测。 在MATLAB中,可以使用HMM工具箱来实现马尔可夫时间序列问题的建模和预测。可以使用HMM工具箱提供的函数来定义HMM模型的参数,包括状态转移概率矩阵、发射概率矩阵和初始状态概率向量。然后,可以使用Viterbi算法或前向-后向算法来进行模型的训练和预测。 在Octave中,可以使用MHMMR(多重隐马尔可夫模型回归)来解决多元时间序列的细分问题。MHMMR模型假设时间序列由一系列隐藏的离散状态控制,并通过制度变化对时间序列进行细分。可以使用MHMMR提供的函数来定义模型的参数,并使用EM算法进行模型的训练和预测。 以下是一个使用MATLAB的HMM工具箱实现马尔可夫时间序列问题的示例代码: ```matlab % 导入HMM工具箱 addpath('hmm_toolbox'); % 定义观测序列 obs = [1, 2, 1, 2, 1]; % 定义状态转移概率矩阵 trans = [0.7, 0.3; 0.4, 0.6]; % 定义发射概率矩阵 emis = [0.9, 0.1; 0.2, 0.8]; % 定义初始状态概率向量 start = [0.5, 0.5]; % 创建HMM模型 model = hmmCreate('Discrete', trans, emis, start); % 使用Viterbi算法进行预测 path = hmmViterbi(model, obs); % 输出预测结果 disp(path); ``` 以上代码中,我们首先导入HMM工具箱,然后定义观测序列、状态转移概率矩阵、发射概率矩阵和初始状态概率向量。接下来,我们使用hmmCreate函数创建HMM模型,并使用hmmViterbi函数进行预测。最后,我们输出预测结果。
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