ChAMP R包安装中的事故

ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样,代码只有简单的两行

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("ChAMP")

我用的电脑是windows 操作系统,64位的R-3.4.3,安装过程中除了网速较慢,花费一点时间安装之外,并没有出现任何的问题。在加载的时候,却发生了如下的错误

错误: package or namespace load failed for 'ChAMP' in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...):
 无法载入共享目标对象‘D:/work/R-3.4.3/library/mvtnorm/libs/x64/mvtnorm.dll’::
  `已达到了DLL数目的上限...

错误信息的意思很明显,达到了dll 文件的上限。那么默认的上限是多少呢?

google了好久,终于找到了解决方案。dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库,在加载R包的过程中,如果这个R包有对应的动态链接库,那么就会加载进来。默认情况下最多允许加载100个动态链接库,当你需要加载的动态链接库超过了100时,就会出现上面的报错信息。

解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统,R语言对应的环境变量都可以在.R

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