欢迎关注”生信修炼手册”!
miRDB通过MirTarget这个软件预测了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,并将其整理成了数据库,网址如下
http://www.mirdb.org/
该数据库中涵盖的物种如下
huaman
mouse
rat
dog
chicken
每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下
除了提供软件预测的靶基因结果外,该数据库还做了一个文献整理的工作,将报导了miRNA前体或者成熟miRNA功能的相关文献收集整理,汇总形成了一个miRNA功能数据库,称之为FuncMir, 该数据库包含了人和小鼠这两个物种中的miRNA信息,示意如下
点击红色链接可以查看详细信息和相关的pubmed文献。
官网提供了两种检索功能
1. target search
该功能一次只可以检索一个miRNA后者gene, 检索框如下所示