miRDB:软件预测的哺乳动物miRNA靶基因数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!

miRDB通过MirTarget这个软件预测了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,并将其整理成了数据库,网址如下

http://www.mirdb.org/

该数据库中涵盖的物种如下

  1. huaman

  2. mouse

  3. rat

  4. dog

  5. chicken

每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下

除了提供软件预测的靶基因结果外,该数据库还做了一个文献整理的工作,将报导了miRNA前体或者成熟miRNA功能的相关文献收集整理,汇总形成了一个miRNA功能数据库,称之为FuncMir, 该数据库包含了人和小鼠这两个物种中的miRNA信息,示意如下

点击红色链接可以查看详细信息和相关的pubmed文献。
官网提供了两种检索功能

1. target search

该功能一次只可以检索一个miRNA后者gene, 检索框如下所示

2. target mining</
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值