
看完不会来揍我
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生信小白要知道
肉体和灵魂 总要有一个在路上
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火爆全网的扩散模型(Diffusion Model)到底是什么?只看这篇就够了!绝对通俗易懂!草履虫看完都要点头!| 附完整代码 + 详细注释
之前介绍机器/深度学习的时候,因为篇幅限制,咱们总是先深度剖析其原理,然后代码后续出!但是很多小伙伴们反映更希望它们整合在一起!要知道,咱们“要知道”主打一个听劝!所以!从这次开始!咱们就原理代码一起来啦!原创 2024-08-31 22:01:01 · 2565 阅读 · 3 评论 -
单细胞分析 | Seurat基础流程 | 保姆级教程
单细胞来咯!单细胞来咯!单细胞来咯!!!原创 2024-08-13 16:57:02 · 15428 阅读 · 9 评论 -
单细胞基地 | 单细胞多样本数据整合 | 两万字大干货
单细胞多样本数据整合终于来啦!原创 2024-08-13 16:36:28 · 4135 阅读 · 1 评论 -
RStudio 服务器进不去啦咋整!R is taking longer to start than usual.
Reload、Safe Mode、Terminate R 都没用!咱不慌!俺带着解决方案来啦!!!原创 2024-08-08 16:58:02 · 3001 阅读 · 0 评论 -
孟德尔随机化(四)—— 终于搞定!遇到 Error in if (nrow(d) == 0) return(NULL) : 参数长度为零 该怎么办!帮你完美解决!
俺要要要终于回来啦!!!今天!咱就帮助大家解决一个困扰多日的问题!是什么呢!铛铛铛铛!就是近期大家在孟德尔随机化分析中最常遇到的或!相信大家一定遇到过!因为我发现,私信和留言,还有交流群内,都快被这个问题刷屏了,而且似乎也没有什么好的解决方案出现!这是咱们使用之前在中的方法在线从 GWAS 数据库下载数据时会遇到的情况,真是让我们一筹莫展、二脸懵逼、三阳开泰、四处碰壁、「五」可奈何、六六不顺、七上八下、「八」酒消愁、「九」命呀!咱不慌!今天!一个偶然的情况下,我突然灵光乍现!就那么一试!哎呀!果然!搞定!原创 2024-07-11 17:03:22 · 14656 阅读 · 32 评论 -
孟德尔随机化(三)—— 再也不用担心网络或其他各种报错啦 | 从数据库下载数据到本地的数据处理方法
很多小伙伴们反映在使用代码下载数据时会遇到各种网络或其他报错问题,令人头大的那种!不要慌!从数据库下载数据到本地的数据处理方法这就来啦!原创 2024-04-19 15:03:25 · 17767 阅读 · 29 评论 -
看完不会来揍我 | 孟德尔随机化(二)—— 代码实操 | 附代码注释 + 结果解读
最近真的是超超超超超超超级多的小伙伴们在咨询孟德尔随机化相关的问题和课程,意想不到的那种多!那我怎么办嘞!整呗!主打的就是一个宠粉!原创 2024-04-15 17:23:57 · 39404 阅读 · 31 评论 -
看完不会来揍我 | R包的下载与安装 | 再也没有一个包可以逃出你的手掌心啦
经常会有小伙伴们在群里提到一些R包安装相关的问题,真的是五花八门的报错内容和玄幻事件!我可太懂了!!!今天,就给你们一次性解决所有R包安装相关问题!!!!!原创 2024-04-02 19:08:02 · 2442 阅读 · 0 评论 -
怎么判断你的模型是好是坏?模型性能评估指标大全!(二)
模型性能评估指标,大家一定不陌生!很多小伙伴们都说难,但是它真的很重要很重要很重要!它会对我们的模型有很多的指导,也会给我们真正做模型的时候提供一些指导性的思想,不然我们看到别人的东西只能跟着人家的思路走,不能有自己的想法,或者说没办法去”批判“他做得好还是不好!这多憋屈呀!来!咱学!给它学得透透的!原创 2024-03-14 23:13:08 · 1585 阅读 · 0 评论 -
生存预后不显著?最佳阈值来帮你!| 附完整代码 + 注释
大家在进行生存预后分析时发现结果不显著,是不是当头一棒!两眼一黑!难不成这就代表我们的研究没意义吗?NONONO!别慌!说不定还有救!快来看看最佳阈值能不能捞你一把!原创 2024-03-13 22:29:22 · 3738 阅读 · 3 评论 -
你要的个性化生信分析服务今天正式开启啦!定制你的专属解决方案!全程1v1答疑!
专属于你的个性化定制分析服务来咯!!!原创 2024-03-08 16:17:14 · 690 阅读 · 0 评论 -
看完不会来揍我 | 生存分析详解 | 从基础概念到生存曲线绘制 | 代码注释 + 结果解读
大名鼎鼎的生存分析来咯!今天我就不叭叭叭了,咱们直接开始冲!(字有点多,希望大家不要嫌弃!)原创 2024-03-08 16:04:19 · 25270 阅读 · 2 评论 -
干货满满 | 给生信小白的入门小建议 | 掏心掏肺版
经常有小伙伴们会问到,**“我该如何入门生信”、“生信小白该怎么开始上手”、“不知道从哪里开始学”、“可以先不学R语言和Linux吗”**等等问题。其实入门这个问题叭,有点庞大,一句两句还真说不清!今天,咱们就来碎碎念一波!原创 2024-01-30 15:47:35 · 6842 阅读 · 0 评论 -
差异分析三巨头 —— DESeq2、edgeR 和 limma 包 | 附完整代码 + 注释
前面我们介绍了[看完还不会来揍/找我 | TCGA 与 GTEx 数据库联合分析 | 附完整代码 + 注释](https://mp.weixin.qq.com/s/VUDl2PUtMVz4kO0CBPSTIg),很多粉丝朋友私信想要我分享一下如何利用得到的混合矩阵进行差异表达分析,那今天我们就一鼓作气!把最最最经典的三个差异分析工具 —— DESeq2, edgeR 和 limma 包,以及如何通过得到的差异基因绘制火山图、热图等等,给大家进行一个详细的介绍!原创 2024-01-28 19:50:12 · 11770 阅读 · 3 评论 -
数据挖掘 | 批次效应的鉴定与处理 | 附完整代码 + 注释 | 看完不会来揍我
数据整合后,批次效应的处理是非常重要的!这里面的学问可大着呢!这不!今天!超级无敌保姆级的批次处理教程来咯!快来看看有没有新鲜的知识叭!原创 2024-01-27 22:08:59 · 7401 阅读 · 7 评论 -
R语言绘图 | 列线图/诺莫图(Nomogram)和校准曲线(Calibration)| 代码注释 + 结果解读
前面已经介绍了高级森林图的画法,今天我们就来介绍另一种用于可视化Logistic或Cox回归分析结果的方式 —— 列线图(Alignment Diagram),也称诺莫图(Nomogram)。原创 2024-01-25 16:01:24 · 13500 阅读 · 1 评论 -
R语言绘图 | 高级森林图(Forest Plot)| 多种方法详解 | 代码注释 + 结果解读
森林图(Forest Plot)用于可视化比较多个研究结果的效应大小和置信区间,通常用于汇总和比较不同研究的结果,特别是在荟萃分析(Meta-Analysis)中。当然,我们之前构建过的也可以用森林图展示结果。森林图提供了一种方式来呈现多个研究的数据,可以帮助我们更好地理解不同研究之间的一致性和差异性,以及整体效应的大小。我们先介绍一下森林图,大家如果不需要的话,也可以跳过这部分直接去看代码实现部分哟!原创 2023-12-22 23:46:05 · 39168 阅读 · 2 评论