Picard工具 - 简介

最新推荐文章于 2024-09-30 11:36:40 发布
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1 简介

Picard是一组命令行工具，用于处理高通量排序（HTS）数据和格式，例如SAM / BAM / CRAM和VCF。这些文件格式在Hts-specs存储库中定义。

2 安装以及使用

具体请参看：Picard官网

使用picard工具去重自己的sam/bam数据
.
10-11 2747
自 2.0.1 版（2015 年 11 月）起，Picard 需要 Java 1.8 (jdk8u66)。支持 Java 1.7 的最后一个版本是 1.141 版。picard是一组用于操作高通量测序 (HTS) 数据和格式的 Java 命令行工具。Picard 现在在 Java 11 下构建并通过测试。实现的，以支持访问通常用于高通量测序数据的文件格式，例如。Picard 是使用 HTSJDK Java 库。去重自己的sam/bam数据。
MusicBrainz-Picard---Naming-Script
03-18
MusicBrainz Picard是一款强大的音乐元数据管理工具，它允许用户通过其独特的音乐指纹识别技术来标记、组织和管理音乐文件。"MusicBrainz-Picard---Naming-Script"是与Picard相关的命名脚本，这通常是用来自动化音乐...
picard:一组用于处理高通量测序数据的工具-开源
04-29
一组工具（使用Java），用于处理SAM / BAM格式的下一代测序数据。 请注意，开发已经移至https://github.com/broadinstitute/picard上的GitHub，并且可以在GATK论坛（http://gatkforums.broadinstitute.org/categories/ask-the-team）上获得支持。
Picard：高效处理测序数据的必备工具
最新发布
公众号/简说基因，知乎/简宝玉
09-30 960
在生物信息学中，处理大规模的测序数据（如RNA-Seq或DNA-Seq）是非常常见的工作。然而，这些数据通常需要进行一系列预处理步骤，比如去除PCR重复、评估文库质量等。Picard是一个被广泛使用的工具集，专门用于处理和分析测序数据，帮助你有效地完成这些任务。今天，我将向你介绍Picard的主要功能、它的优缺点，以及如何通过Galaxy平台（usegalaxy.cn）来简化使用。Picard是...
Picard Tools
weixin_30666943的博客
11-29 2480
Picard Tools - By Broad Institute http://broadinstitute.github.io/picard/command-line-overview.html java version "1.8.x" java -jar /path/to/picard.jar -h Full list of Picard tools Ad...
Picard-tools install trimmomatic workflow【仅做记录】
rzl1122333的博客
07-09 2174
花了大半天去配环境，配包，结果  sudo apt-get install picard-tools 就够了 picard 是个其他的软件，之前装错过，要take care sudo apt-get install trimmomatic 直接装  apt再去删
探秘基因数据处理的利器：Picard工具包
gitblog_00469的博客
08-09 581
探秘基因数据处理的利器：Picard工具包 picardA set of command line tools (in Java) for manipulating high-throughput sequencing (HTS) data and formats such as SAM/BAM/CRAM and VCF.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/p...
Picard 工具套件指南
gitblog_01057的博客
09-09 720
Picard 工具套件指南 picardPICARD - Parsing Incrementally for Constrained Auto-Regressive Decoding from Language Models. PICARD is a ServiceNow Research project that was started at Element AI.项目地址:https://g...
PyPI 官网下载 | picard-2.7.3-cp38-cp38-macosx_10_14_x86_64.whl
02-05
picard库通常提供了丰富的API和命令行工具，可以进行元数据的搜索、替换、导入导出等操作。 总的来说，picard是一个强大的Python库，专注于音乐元数据的管理和编辑，而picard-2.7.3-cp38-cp38-macosx_10_14_x86_64....
Python库 | picard-2.5.1-cp37-cp37m-win_amd64.whl
03-23
picard通常指的是音乐元数据处理的工具，但在这里可能是开发者为其赋予了不同的意义或是一个自定义的库。版本号2.5.1指示这是该库的第2.5.1次更新，通常意味着修复了一些错误、增加了新功能或者进行了性能优化。 ...
音乐整理软件Picard.zip
07-16
Picard 是一个用 Python 编写的跨平台音乐标签管理工具，支持 Windows 、 Mac OS X 和 Linux 。Picard 支持大多数音频文件格式，执行CD查找和光盘ID提交，并且拥有出色的Unicode支持，自动匹配Tag、下载专辑封面的软件。它的数据库来源于非营利的互联网音乐专辑数据库 MusicBrainz 。此外，Picard 还有多个插件可用于扩展功能。当标记文件时，Picard 使用 album-oriented 的方法。 这种方法允许它尽可能有效地利用 MusicBrainz 的数据，并正确地标记你的音乐。  标签：Picard
picard sequence analysis utility
12-16
A set of Java command line tools for manipulating high-throughput sequencing (HTS) data and formats. Picard is implemented using the HTSJDK Java library[HTSJDK][1], supporting accessing of common file formats, such as [SAM][2] and [VCF][3], used for high-throughput sequencing data.
picard:一组用于处理高通量排序（HTS）数据和格式（例如SAMBAMCRAM和VCF）的命令行工具（Java）
04-28
用户支持： 对于用户问题，请寻找答案并先在。 一组Java命令行工具，用于处理高通量排序（HTS）数据和格式。 Picard使用HTSJDK Java库以支持访问通常用于高通量测序数据的文件格式，例如和 。 Picard现在在Java 11下构建并通过测试。这应该被视为Beta功能。 从2.0.1版开始（2015年11月），Picard需要Java 1.8（jdk8u66）。 支持Java 1.7的最新版本是1.141版。 建筑皮卡德 首先，克隆仓库： git clone https://github.com/broadinstitute/picard.git cd picard/ Picard现在使用。 包含了包装器脚本（ gradlew ），该脚本将在首次调用时下载相应版本的gradle。 要构建包含所有依赖项的完全打包的，可运行的Picard jar，请运行
picard:Picard工具的练习回购
05-21
一组Java命令行工具，用于处理高通量排序（HTS）数据和格式。 Picard是使用HTSJDK Java库实现的，该库支持访问用于高通量测序数据的常见文件格式，例如和 。 也可以构建一个支持从GA4GH API读取的Picard版本，例如...
MusicBrainz Picard - 智能音乐标签管理器
gitblog_00046的博客
03-15 750
MusicBrainz Picard - 智能音乐标签管理器 去发现同类优质开源项目:https://gitcode.com/ 是一个强大的音乐标签管理器，由 MusicBrainz 开发并维护。它可以帮助您组织、管理和识别您的音乐收藏，并提供高级功能以满足您的需求。 项目简介 Picard 是一款免费的跨平台应用程序，可在 Windows、macOS 和 Linux 上运行。它使用 MusicB...
生信软件2 - 下游比对数据的统计工具 picard
LittleComputerRobot的博客
03-11 2466
Picard是一组命令行工具，用于处理高通量排序数据和格式，如sam/ bam/ cran和vcf文件。
Picard 工具包安装与使用指南
gitblog_00310的博客
09-09 328
Picard 工具包安装与使用指南 picardPICARD - Parsing Incrementally for Constrained Auto-Regressive Decoding from Language Models. PICARD is a ServiceNow Research project that was started at Element AI.项目地址:https...
Picard 法求方程根
weixin_34096182的博客
10-26 4490
要点: 首先对于任何方程 ：f(x)=0 ，可以转换成 f(x)+x-x => f(x)+x=x; 取g(x)=f(x)+x;  那么 新方程g(x)=x 的解即是 f(x)=0的解，即g(x)-x=0 成立时有 f(x)+x-x=0 现在研究g(x)=x 的解，该方程的解对应 函数 y=g(x) 与 函数y=x的交点(x1,y1)的x坐标即x1. 函数y=x 是对称直线,上面的的任意点(x...
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