Warning in install.packages : package ‘limma’ is not available for this version of R

XH生信ML笔记

于 2021-04-21 11:05:40 发布

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分类专栏： Troubleshooting

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本文详细介绍了如何解决在R环境中安装limma和biobase基因芯片包时遇到的问题。首先需要通过BiocManager安装包管理器，接着使用BiocManager::install()命令完成安装。该文为生物信息学研究者提供了实用的解决方案。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

1. limma 包安装

在安装基因芯片包limma和biobase时，出现了“Warning in install.packages : package ‘limma’ is not available for this version of R”报错。原因是先得下载bioconductor的包管理器biocmanager，然后即可安装：

> install.packages("limma")
Warning in install.packages :
  package ‘limma’ is not available for this version of R

A version of this package for your version of R might be available elsewhere,
see the ideas at
https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

报错，显示这个版本的r没有limma包。查询limma官网，发现:

Installation

To install this package, start R (version “4.0”) and enter:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("limma")

运行此代码，成功安装。

2. biobase包安装

BiocManager::install("Biobase")

成功