conda安装scglue过程中出现的问题
刚开始复现Multi-omics single-cell data integration and regulatory inference with graph-linked embedding的代码时,想导入代码给的env环境一直无法导入,最后发现本篇论文的代码是在Unbantu上跑的,没有办法了只能按了一个虚拟机。在虚拟机上还是想继续导环境一直还是没有成功,只能一个一个下载了
scglue官方中文文档https://scglue.readthedocs.io/zh_CN/latest/
使用pip install scglue 命令安装scglue包在此过程中一直报错,错误如下所示
百度搜了一些解决办法一直没有成功,最后发现是镜像的问题,原来的镜像下载的有点慢了,根据https://blog.csdn.net/qq_35764295/article/details/125990866
此篇文章更换了豆瓣源
重新安装以后下载速度明显增快,但是又出现了新的问题,如下
错误原因:这是因为未安装Microsoft Visual C++ 14.0,安装方法是
https://zhuanlan.zhihu.com/p/137861452
我用了第一个方法
根据此网页在unbantu上安装了code,但是后面的示例没有跑通一直报错,也没在管他。
又根据https://stackoverflow.com/questions/71470989/安装了pip install Cmake还是报错
出现这个错误百度了一下是gcc的问题,用了这两个命令安装了gcc
sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install g++
pip install scglue -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com
终于把scglue安装成功了!!!