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RSS订阅原创 测序相关
一、二代测序在illumina的测序文件中，采用双端测序（paired-end），一个样本得到的是seq_1.fastq.gz和seq_2.fastq.gz两个文件，每个文件存放一段测序文件。1.terminal sequence：保护碱基2.adapter:接头序列，adapter适合flowcell上的接头互补配对结合3.index：索引序列，特意序列，提高Illumina测序仪的使用率，同一泳道可能会测序多个样品，样品间的区分通过index区分4.Primer Binding Site：引物
2021-03-15 13:53:46
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原创 Linux服务器1
一、服务器介绍使用工具简介：xshell(远程访问)、xftp(传输文件)搭建、开启环境相关 ——miniconda（或者Anaconda）1.conda是指开源包管理系统和环境管理系统，可以简单的认为是如果存在多个python版本，则可方便切换不同版本的python环境2.Anaconda包含conda、某个版本的python、众多packages和科学计算包以及各种不常用的库3.miniconda则是Anaconda的精简版，只包含conda和python，以及必要的相关依赖性，如果需要
2021-03-15 09:50:24
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原创 文献实现基因组装工具实现2_Ra
实现2 Ra仍然是在实现1的条件下进行实验步骤进入Ra的Github页面，下载其源代码尝试使用git clone方式但存在以下问题：下载缓慢，经常下载不全 - 了解[**Git**菜鸟教程](https://www.runoob.com/git/git-tutorial.html)，详情请见[Git相关简明指南](https://www.runoob.com/manual/git-guide/)附注：下载Git，使用Git cmd，推荐使用git clone方式，下载源代
2021-03-10 10:37:21
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原创 文献实现之基因组组装_实现1
实现1 AlignGraph2一切都在VirtualBox下新建Linux虚拟机Centos7上实现，通过共享文件夹的方式从windows系统，向虚拟机传输所需文件附注：每次虚拟机系统关机或重启需要重新挂载共享文件夹步骤了解Github、Git命令(以便于下载源代码)Github介绍，详情请见韩顺平简介Github了解Git菜鸟教程，详情请见Git相关简明指南附注：下载Git，使用Git cmd，推荐使用git clone方式，下载源代码，不推荐使用download zip，
2021-03-08 10:33:31
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原创 原始测序数据来源——SRA数据库
一、SRA数据库简介SRA数据库SRA——Sequence Read Archive（存档来自各种高测序平台的原始测序数据和比对信息）数据（Studies（研究课题）、Experiments（实验设计）、Runs（测序结果集）、Samples（样品信息）（Studies->Experiments->Samples->Runs））SRA数据库用不同前缀表示：1、ERP或SRP表示Studies2、SRS表示Samples3、SRX表示EXperiments4、SRR表示
2021-03-06 21:55:27
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原创 python实战项目1-图片转字符画
python实战项目1-图片转字符画思路得到RGB值将RGB值对应到字符上最初图像->结果图像完整代码思路图片->字符：（1）下载下来的图片（2）分析RGB值（3）RGB值->字符表示（中间过程可转换形成灰度值，再对应字符）得到RGB值import cv2import numpy as npimg = cv2.imread("D:\\try_try\\dlAm2.jpg", 1)imgInfo = img.shapeheight = imgInfo[0]width
2020-09-21 21:36:04
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空空如也
空空如也
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