被特殊物种序列虚晃一枪的日子

前言二代测序实属物种鉴定的利器,将其整合进呼吸介入诊断体系之后实属如虎添翼。除了操作前的临床理化影像分析,操作中的快速现场评价(Rapid On-Site Evaluation,ROSE)和操作后的宏基因组二代测序(Metagenomic Next Generation Sequencing,mNGS)大大提高了呼吸介入操作的诊断效率。但这些技术在应用过程中仍需要存在很多具体问题,需要在实践中不断探索解决。尤其是在发现疑似特殊类型病原体时,需要严谨的验证,并在这个过程中不断完善分析流程。缘起...
摘要由CSDN通过智能技术生成

以下内容,纯属虚构,如有雷同,哇哈哈哈。

前言

二代测序实属物种鉴定的利器,呼吸介入诊断体系将其纳入之后如虎添翼。除了操作前的临床理化影像分析,操作中的快速现场细胞学评价(Rapid On-Site Evaluation,ROSE)和操作后的宏基因组二代测序(Metagenomic Next Generation Sequencing,mNGS)大大提高了呼吸介入操作的诊断效率。但这些技术在应用过程中仍需要存在很多具体问题,需要在实践中不断探索解决。尤其是在发现疑似特殊类型病原体时,需要严谨的验证,并在这个过程中不断完善分析流程。

缘起

病房接连入住两名患者,均因为基础病情而处于免疫抑制状态,肺内病变较为复杂,鉴别诊断当中包括了病毒性感染不能除外。一名患者病情进展非常迅猛,另一名患者病情已经进入吸收恢复期。按照我的操作常规,灌洗刷检活检一应俱全,各路标本分别送检,其中就包括病变部位的支气管肺泡灌洗液(Broncho-Alveolar Lavage Fluid,BALF)送检mNGS。检测公司非常给力,出具检测报告的同时还会提供下机数据,客户支持做得非常到位,不像其他有些公司店大欺客,张口闭口要这要那,完全不给自己提供任何业务机会。
由于患者病情加重,各级查房都非常重视。拿到数据之后,就按照之前《宏基因组单个样本数据处理流程笔记》当中所述流程进行分析。最后点开花冠图,就觉得出现了一个值得注意的物种,占据病毒界的比例

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