WEGA算法——基于分子形状的三维相似度计算方法

分子形状比较方法广泛应用于药物研发领域，如虚拟筛选，骨架跃迁以及分子叠合等。分子形状比较方法一般而言分为两种，一种是直接的形状比较；另一种是基于形状描述符的比较。虽然基于形状描述符的比较方法速度较快，但是具有局限性——两个相似的分子，其描述符可能不尽相同。

描述符

目前学术界认为直接形状比较方法更有效，因为这些方法通常可以获得形状匹配的最佳对齐，并且可以发现一些有用的信息来解释为什么某些配体比其他配体活性更好。