当虚拟筛选遇上高通量筛选

 

新药研究属于高科技领域,世界各国对新药研究的投入逐年增加。据统计,1981年全世界对R&D投入为52亿美元,至1996 年已达到450亿美元。虽然新药研究开发的投入逐年增加,但每年上市的新的一类新药(NCE)却逐年减少,60年代初期,每年上市的NCE约100 个,1996年仅40个,由此可见,平均每一个新药的成本亦大幅度的增加。

人类基因组计划的完成以及后续功能基因组(结构基因组、蛋白质组和代谢组等)计划的实施,深刻地改变了药物研究和开发的思路及策略,形成了新药研究的新模式--从基因组到药物(fromgenome to drug),包括新靶标的发现与确证、先导化合物的发现与优化以及药物开发。其中,先导化合物的发现过程中,常用的筛选方式有高通量筛选(High throughput screening,HTS)和虚拟筛选(virtual screening,VS)。

 

高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系,简言之就是可以通过一次实验获得大量的信息,并从中找到有价值的信息。


 

但传统的高通量筛选遇到许多问题,一是药理测试假阳性与假阴性结果;二是化合物样品来源短缺;三是通用性不高,很多HTS方法只对一种或几种酶具有适应性;四很多高通量筛选方法中所用到的试剂和仪器都非常昂贵,很多实验室都无法配备,而与大型制药企业相比,大部分科研单位没有这样的经济实力。

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