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来数据分析小超市逛逛
数据分析小超市原创 2022-07-16 17:44:21 · 326 阅读 · 1 评论 -
如何快速学会画漂亮的ROC图
pROC是一个专门用来计算和绘制ROC曲线的R包,目前已被CRAN收录,因此安装也非常简单,同时该包也兼容ggplot2函数绘图,本次就教大家怎么用pROC来快速画出ROC图。在医学领域主要用于判断某种因素对于某种疾病的诊断是否有诊断价值。什么是ROC曲线和AUC,以及如何去看ROC曲线的结果,可以这样总结:ROC曲线呢,其实就是每个对应的cutoff值都有一个对应的真阳性率(纵坐标)和假阳性率(横坐标),比如选择了10个cutoff值,那就相当于有个10个点,把这些点连成一条线就是ROC曲线。AUC值就是原创 2022-05-21 22:25:04 · 4026 阅读 · 0 评论 -
如何利用ggplot2画发文章级别的t-SNE图
快速掌握画TSNE原创 2022-05-21 22:19:44 · 1624 阅读 · 0 评论 -
如何给热图heatmap添加指定的标签?
给热图heatmap添加指定标签原创 2021-12-10 00:48:08 · 4700 阅读 · 1 评论 -
甲基化数据如何与基因表达谱数据联合分析
DNA的甲基化往往与基因的转录活性成反比,所以DNA的甲基化程度势必会影响基因的表达水平,进而影响基因的功能。今天我们就来看看如何将甲基化数据和基因表达水平数据进行整合分析。在次之前呢,需要先给大家说一下甲基化驱动基因(methylation-driven genes)的概念,如一个基因在癌症样本中相比正常样本低表达,而该基因在癌症样本中被高度甲基化,那么该基因就是一个methylation-driven gene。以下为完整的分析流程:![分析流程图](https://img-blog.csdnimg原创 2021-01-07 20:27:51 · 4471 阅读 · 0 评论