学习笔记|fmri_4 预处理 co- register segment normalize smooth SPM12

本文详细介绍了fMRI预处理的四个关键步骤:co-register(结构功能配准),segment(结构像分割),normalize(标准化)和smooth(平滑处理)。co-register将功能图像与结构图像对齐,segment对结构像进行白质、灰质和脑脊液分割,normalize使个人脑图像与标准模板配准,最后通过smooth减少噪声并提高信号一致性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

到这里可以往回看预处理包括哪些步骤:可视化(Visualization)、去伪影(Artifact removal)、时间配准(Slice time correction)、头动校正(Motion correction/realign)、生理噪音校正(Correction for physiological effect)、结构功能配准(Co-registration)、标准化(Normalization)和时空间滤波(Spatial and temporal filtering)。
注:很多教程的预处理步骤都不太一样,按需找教程参考。

链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/22385985
附一个知乎链接,fmri概念讲解比较简洁清楚

下面就接着记录motion correction之后的预处理步骤,motion之类的操作见学习笔记|fmri_3

视频链接:https://b23.tv/ixIeQb 从28min开始,因为之前的视频p6到p7直接跳到1st level analysis(fMRI数据分析:从MRI理论讲解到SPM操作,https://www.bilibili.com/video/BV1Vt411c7D5?p=6)。
缺少后续预处理教程,所以换一个看,补充一下。

1 co- register

把不同被试的大脑放到标准空间里,为了和后面MNI标准大脑对到一起。
根据结构像定位功能像,把功能图像上的点定位在有着较高分辨率的结构图像上。

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