欢迎参加郑老师2023年孟德尔随机化课程即将开始
孟德尔随机化,Mendilian Randomization，简写为MR，是一种在流行病学领域应用广泛的一种实验设计方法，利用公开数据库就能轻装上阵写文章，甚至是高质量的论文。
孟德尔随机化通过引入一个称之为工具变量的中间变量，来分析暴露因素和结局之间的因果关系，解决了传统实验方法由于混杂因素的存在，而无法有效说明暴露因素和结局变量之间因果性的问题。
通过PubMed数据库“ Mendelian randomization”检索发现，10.11-10.17共发表27篇相关主题论文，其中共7篇医学1区，5篇医学2区文章，部分文章介绍如下。
中国学者：
1.中国学者文章介绍（一）
文章题目：转录组学分析揭示了基于血液的A-to-I编辑与帕金森病的关联
研究目的：腺苷-肌苷(A-to-I)编辑是人类最常见的RNA编辑类型，A-to-I RNA编辑在帕金森病(PD)中的作用尚不清楚。我们旨在探索A-to-I编辑与PD之间的潜在因果关系，并评估A-to-I编辑的改变是否与PD的认知进展相关。
方法：使用来自380名PD患者和178名帕金森进展标志物倡议队列中的健康对照的RNA-seq数据来量化A-to-I编辑位点。通过整合全基因组关联研究，我们进行了顺式rna编辑数量性状位点分析和两样本孟德尔随机化(MR)研究，以推断a -to- i编辑与PD发病机制之间的潜在因果关系。基于summary -data的MR分析进一步证实了潜在的因果A-to-I编辑位点。采用Spearman相关分析来表征纵向A-to-I编辑与PD患者认知进展之间的关系。
结果：我们确定了PD的17个潜在因果A-to-I编辑位点，并指出遗传风险变异可能通过A-to-I编辑增加PD的风险。这些A-to-I编辑位点位于基因NCOR1、KANSL1和BST1。此外，我们观察到57个位点的纵向A-to-I编辑水平与PD的认知进展相关。
结论：我们发现了PD发病的潜在因果A-to-I编辑位点，A-to-I编辑的纵向变化与PD的认知进展有关。我们预计这项研究将提供新的生物学见解，并推动发现帕金森病的表转录组学作用。
2.中国学者文章介绍（二）
文章题目：内脏脂肪组织与痛风的关联:观察性和孟德尔随机化分析
研究目的：内脏脂肪组织(VAT)与痛风之间的因果关系尚不清楚。我们的目的是通过观察性和孟德尔随机化(MR)分析来检验两者之间的潜在关联。
方法：采用观察性分析方法，从全国健康与营养调查中纳入11967名参与者(年龄39.5±11.5岁)。Logistic回归模型用于调查增值税质量与痛风风险之间的关系。在双样本MR分析中，211个VAT质量相关的独立遗传变异(来自325,153名英国生物库参与者的全基因组关联研究)被用作工具变量。采用随机效应反方差加权(IVW)法进行初步分析。还进行了额外的敏感性分析来验证我们的结果。
结果：观察性分析发现，在控制混杂因素后，VAT质量(每标准差)的增加与痛风的高风险相关(优势比[OR] = 1.27, 95%置信区间[CI] = 1.11-1.45)。两样本MR分析显示，在初级分析中，VAT质量增加与痛风风险之间存在因果关系(OR = 1.78, 95% CI = 1.57-2.03)。敏感性分析也显示了类似的结果，包括MR-Egger、加权中位数、简单模式、加权模式和遗漏分析。
结论：观察性分析显示，VAT质量与痛风风险存在密切关联。同时，MR分析也提供了两者之间因果关系的证据。总之，我们的研究结果表明，有针对性的干预VAT质量可能有利于预防痛风。
3.中国学者文章介绍（三）
文章题目：非酒精性脂肪性肝病与22种肝外癌的因果关系:一项孟德尔随机研究
研究目的：目前尚不清楚NAFLD是否作为多发性肝外癌的直接因素。我们的目的是系统地研究非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)与肝外癌的因果关系。
方法：我们进行了一项双样本孟德尔随机化(MR)分析，以评估NAFLD对22例肝外癌的因果关系。我们在迄今为止最大的全基因组关联研究(GWAS)荟萃分析中使用多种方法检查了NAFLD与肝外癌的关联。我们也重复了这些分析，并在英国生物银行最大的GWAS中进行了两次独立的敏感性分析。
结果：我们进行了一项双样本孟德尔随机化(MR)分析，以评估NAFLD对22例肝外癌的因果关系。我们在迄今为止最大的全基因组关联研究(GWAS)荟萃分析中使用多种方法检查了NAFLD与肝外癌的关联。我们也重复了这些分析，并在英国生物银行最大的GWAS中进行了两次独立的敏感性分析。
结论：基因预测NAFLD与女性乳腺癌、宫颈癌、喉癌、白血病、肺癌和前列腺癌的风险增加有关。
4.中国学者文章介绍（四）
文章题目：氨基酸与结肠腺癌的风险:孟德尔随机研究
研究目的：肿瘤细胞中氨基酸代谢重编程的存在已得到证实。然而，血液中氨基酸与结肠腺癌风险之间的潜在关联在很大程度上仍未被探索。
方法：我们采用孟德尔随机化(MR)分析来检测血液中20种氨基酸与结肠腺癌风险之间的关系。此外，反向MR被用来确定反向因果关系的存在。进行了两步MR，以确定潜在的中介作用。最后，利用我院结肠腺癌患者丙氨酸检测数据，探讨健康个体与结肠癌患者、不同分期、不同部位结肠癌患者丙氨酸水平的差异。此外，采用Kaplan-Meier曲线检验丙氨酸与总生存率之间的相关性，随后进行COX单因素分析。
结果：本研究结果提示丙氨酸与结肠腺癌发生风险呈负相关。此外，我们没有发现明显的证据支持结肠腺癌和丙氨酸之间的因果关系。此外，我们的分析显示，谷丙转氨酶(ALT)和血糖在这一因果途径中不起中介作用。此外，被诊断为结肠腺癌的个体丙氨酸水平显著降低，特别是在伴有远处转移的IV期结肠腺癌患者。此外，在结肠腺癌患者中，丙氨酸水平的升高与总体生存率的提高有关。
结论：本研究结果表明丙氨酸对结肠腺癌的发生具有保护作用，并可能在促进更有利的疾病预后中发挥作用。因此，旨在增加丙氨酸摄入量的饮食干预可能作为预防和治疗结肠癌的潜在策略。
外国学者
1.外国学者文章介绍（一）
文章题目：身高、自身免疫性甲状腺疾病和甲状腺癌:一项孟德尔随机研究
研究目的：流行病学研究表明，身高增加与甲状腺功能减退或甲状腺癌的风险增加有关。然而，身高与甲状腺功能减退或甲状腺癌之间的潜在因果关系尚未得到充分探讨。自身免疫性甲状腺疾病(AITD)主要表现为甲状腺功能减退，因此我们旨在评估身高暴露与AITD或甲状腺癌之间的因果关系。
方法：使用与身高相关的遗传工具进行孟德尔随机化(MR)分析，这些工具是从最大的全基因组身高关联荟萃分析中选择的，涉及540万个体。从大量可用的全基因组关联研究中收集了AITD和甲状腺癌的汇总数据(分别包括30,234例和3001例)。采用双向MR检验AITD与成人身高之间的反向因果关系。
结果：MR分析显示，遗传预测身高每增加1个标准差(SD)， AITD的风险增加4% ([CI 1.02 ~ 1.07]， p值= 1.99E-03)。双向MR未显示AITD与成人身高有任何因果关系。此外，基因预测身高每增加1-SD，甲状腺癌风险增加15% ([CI 1.07至1.23]，p值= 2.32E-04)。敏感性分析证实了主要结果。
结论：这项MR研究表明，基因预测身高1-SD的增加与AITD和甲状腺癌的风险增加有关。相比之下，没有证据表明基因预测的AITD与身高有因果关系。这些结果可以进一步帮助研究身高相关的途径，作为获得AITD和甲状腺癌新的机制见解的手段。
2.外国学者文章介绍（二）
文章题目：宫内生长和后代神经发育特征:挪威母亲、父亲和儿童队列研究(MoBa)的孟德尔随机化分析
研究目的：传统的流行病学分析表明，低出生体重与后来的神经发育困难有关;然而，这种联系是否有因果关系尚不清楚。旨在探讨宫内生长与子代神经发育障碍的关系。
方法：MoBa是一项以人群为基础的妊娠队列研究，从1999年6月至2008年12月招募了孕妇，包括大约114,500名儿童、95,200名母亲和75,200名父亲。用传统的流行病学方法评估出生体重和神经发育困难之间的观察性关联。通过孟德尔随机化分析，研究了母亲出生体重等位基因得分与后代神经发育障碍之间的潜在因果关系。
暴露:出生体重和母亲出生体重的等位基因得分(来自与出生体重密切相关的遗传变异)分别是观察性和孟德尔随机化分析中的暴露。
主要结局和测量方法:在6个月、18个月、3岁、5岁和8岁时对后代神经发育困难的临床相关母亲评分，评估语言和运动困难、注意力不集中和多动冲动、社交沟通困难和重复行为。
结果：常规流行病学样本包括46 970个后代，孟德尔随机化样本包括44 134个后代(后代出生年份中位数为2005年[范围，1999-2009年];产妇出生时平均年龄30.1[4.5]岁;父亲出生时平均年龄32.5[5.1]岁)。传统的流行病学分析发现，出生体重与多个子代年龄的几个领域呈负相关(自闭症相关特征评分结果:3岁时社会沟通问卷[SCQ]满，β = -0.046 [95% CI， -0.057至-0.034];scq -限制性和重复性行为量表3年时，β = -0.049 [95% CI， -0.060 ~ -0.038];注意缺陷/多动障碍[ADHD]特征评分:儿童行为检查表[CBCL]-ADHD亚量表在18个月时，β = -0.035 [95% CI， -0.045 ~ -0.024];3年时CBCL-ADHD， β = -0.032 [95% CI， -0.043至-0.021];5年时CBCL-ADHD， β = -0.050 [95% CI， -0.064 ~ -0.037];8岁破坏性行为障碍(RS-DBD) -ADHD评定量表，β = -0.036 [95% CI， -0.049 ~ -0.023];8岁时rs - dbd -注意力不集中，β = -0.037 [95% CI， -0.050 ~ -0.024];8岁时rs - dbd -过度活跃-冲动行为，β = -0.027 [95% CI， -0.040 ~ -0.014];Conners父母评定量表-修订[简略形式]5岁时，β = -0.041 [95% CI， -0.054至-0.028];18个月时问卷-运动困难[ASQ-MOTOR]， β = -0.025 [95% CI， -0.035 ~ -0.015];3年ASQ-MOTOR， β = -0.029 [95% CI， -0.040至-0.018];儿童发展量表- 5岁时粗细运动技能，β = -0.028 [95% CI， -0.042至-0.015])。孟德尔随机化分析没有发现任何证据表明母亲出生体重的等位基因得分与后代神经发育障碍之间存在关联。
结论：本研究发现，以母体出生体重遗传变异为代表的母体宫内环境不太可能是后代神经发育结局的主要决定因素。
3.外国学者文章介绍（三）
文章题目：血浆脂联素水平与心力衰竭、心房颤动、主动脉瓣狭窄和心肌梗死的风险:大规模观察和孟德尔随机化证据
研究目的：脂联素可能在心力衰竭及相关心血管疾病中发挥重要的保护作用。我们假设血浆脂联素与心力衰竭、心房颤动、主动脉瓣狭窄和心肌梗死的遗传风险存在观察性和因果关系。
方法与结果：在哥本哈根普通人群研究中，我们对30,045人的血浆脂联素进行了观察性检测，并对96,903人进行了单样本孟德尔随机化分析，使用五种遗传变异解释了3%的血浆脂联素变异。在HERMES, UK Biobank, the north - tro ndelag Health Study(HUNT)， deCODE, Michigan Genomics Initiative(MGI)， DiscovEHR和AFGen联盟中，我们对1030836名个体进行了两样本孟德尔随机化分析，使用12种遗传变异解释了14%的血浆脂联素变异。在线性建模的观察性分析中，1个单位对数转换的高血浆脂联素与心力衰竭的风险比为1.51(95%可信区间:1.37-1.66)，心房颤动的风险比为1.63(1.50-1.78)，主动脉瓣狭窄的风险比为1.21(1.03-1.41)，心肌梗死的风险比为1.03(0.93-1.14);高于中位数的水平也与心肌梗死风险增加有关，在调整程度较低的模型中，心力衰竭、主动脉瓣狭窄和心肌梗死的非线性u型关联更为明显。单样本孟德尔随机化分析的遗传、因果风险比分别为0.92(0.65-1.29)、0.87(0.68-1.12)、1.55(0.87-2.76)和0.93(0.67-1.30)，非线性单样本孟德尔随机化分析的遗传、因果风险比无显著相关性;两样本孟德尔随机化分析对应的因果风险比分别为0.99(0.89-1.09)、1.00(0.92-1.08)、1.01(0.79-1.28)和0.99(0.86-1.13)。
结论：观察发现，血浆脂联素升高与心力衰竭、心房颤动、主动脉瓣狭窄和心肌梗死的风险增加有关。然而，遗传证据并不支持这些关联的因果关系。
4.外国学者文章介绍（四）
文章题目：胆固醇酯转移蛋白抑制在心血管疾病之外的作用
摘要：胆固醇酯转移蛋白(CETP)的主要作用是在高密度脂蛋白(HDL)颗粒与富含甘油三酯的脂蛋白和低密度脂蛋白(LDL)颗粒之间传递胆固醇酯和甘油三酯。关于抑制CETP作为减少主要不良心血管事件的靶点的研究已有很长的历史。最初，CETP抑制剂对心血管事件的潜在影响被假设是通过它们增加高密度脂蛋白胆固醇的能力来介导的，但是，基于anacetrapib和最新的CETP抑制剂obicetrapib的证据，现在人们认为它主要是由于降低LDL胆固醇和载脂蛋白b。然而，越来越多的证据表明HDL的其他作用，包括促进胆固醇外排。以及它的载脂蛋白组成和抗炎、抗氧化和抗糖尿病的特性，可能在心血管疾病以外的几种疾病中发挥重要作用，包括但不限于阿尔茨海默病、糖尿病和败血症。此外，尽管孟德尔随机化分析表明，较高的高密度脂蛋白胆固醇与年龄相关性黄斑变性(AMD)的风险增加有关，但在所有CETP抑制剂随机对照试验数据中，超过70,000名患者没有出现AMD的过度风险。事实上，相反，某些HDL亚类可能对治疗黄斑变性视网膜胆固醇积累有益。本文综述了有关HDL和CETP抑制与阿尔茨海默病、2型糖尿病、败血症和AMD之间关系的最新生物学证据。
5.外国学者文章介绍（五）
文章题目：低叶酸人群中MTHFR与中风和心脏病风险:一项包含156000名中国成年人的前瞻性研究
研究目的：在中国等低叶酸人群中，叶酸与脑卒中预防的相关性尚不确定。亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR) C677T多态性增加血浆同型半胱氨酸(tHcy)水平的遗传学研究，可以阐明在没有叶酸强化的人群中，tHcy水平升高与中风、缺血性心脏病(IHD)和其他疾病的因果关系。
方法：在中国慢性病前瞻性研究中（China Kadoorie Biobank），156 253名参与者进行了MTHFR基因分型，12 240名参与者在12年的随访期间发生了中风。在调整年龄和性别后，采用Logistic回归方法比较MTHFR C677T (MTHFR C677T多态性677位的两个胸腺嘧啶等位基因)TT基因型与CC(两个胞嘧啶等位基因)的总卒中和卒中类型、IHD和其他疾病的区域特异性比值比(ORs)，并使用反方差加权方法将这些比值比结合起来。
结果：总体而言，21%的参与者具有TT基因型，但在10个研究区域中，这一比例从5%到41%不等。TT基因型个体发生任何中风的风险比参考CC基因型高13%(校正OR 1.13, 95% CI 1.09-1.17)[与脑出血(1.24,1.17-1.32)的相关性比缺血性中风(1.11,1.07-1.15)的相关性强2倍]。相比之下，MTHFR C677T与IHD或任何其他非血管疾病(包括癌症、糖尿病和慢性阻塞性肺疾病)的风险无关。
结论：在中国成年人中，MTHFR C677T多态性与较高的卒中风险相关。进一步的叶酸试验和在低叶酸人群中实施强制性叶酸强化计划来预防中风，证实了这些发现。
6.外国学者文章介绍（六）
文章题目：28161名英国生物银行参与者心包脂肪区全基因组关联研究
研究目的：心包脂肪组织(PAT)是包围心脏的内脏脂肪组织隔室。实验和观察研究表明，较大的PAT沉积可能介导心血管疾病，与全身或皮下脂肪无关。在28161名英国生物银行参与者中，我们描述了脂肪调整PAT的遗传结构，并确定了PAT与心脏结构和功能的不良心脏磁共振成像测量之间的因果关系。
方法与结果：使用先前在该队列中开发并验证的自动图像分析工具从心脏磁共振图像中提取PAT表型。进行了一项全基因组关联研究，将PAT区域设置为表型，调整年龄、性别和其他肥胖指标。使用功能映射和贝叶斯共定位来了解已识别变体的生物学作用。孟德尔随机化分析用于检验基因决定的PAT与心脏磁共振衍生的左室结构和功能测量之间的潜在因果关系。我们发现了12个全基因组显著变异，其中2个独立的前哨变异(rs6428792, P=4.20×10-9和rs11992444, P=1.30×10-12)位于2个不同的基因组位点，通过功能注释定位到3个潜在的致病基因:T-box转录因子15 (TBX15)、色氨酸tRNA合成酶2、线粒体(WARS2)和早期b细胞因子2 (EBF2)。贝叶斯共定位还提示了RP4-712E4.1的作用。基因预测的脂肪调节PAT差异与不良左心室重构有因果关系。
结论：本研究提供了决定差异PAT沉积的遗传结构的见解，确定了与左侧结构和功能参数的因果关系，并提供了关于肥胖分布的病理生理重要性的新数据。
其他一二区文章：
1023
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
